13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0513 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0513  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  574  1.0000000000000001e-163  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.891131  normal  0.375545 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0714  hypothetical protein  78.31 
 
 
286 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0307809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1417  hypothetical protein  51.18 
 
 
259 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1150  hypothetical protein  50.39 
 
 
259 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.48497  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0262  hypothetical protein  47.33 
 
 
266 aa  242  6e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3348  hypothetical protein  49.22 
 
 
260 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0067  hypothetical protein  41.54 
 
 
261 aa  218  7e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0645  hypothetical protein  62.04 
 
 
164 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.881182  normal  0.484596 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4887  hypothetical protein  32.82 
 
 
275 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4514  hypothetical protein  26.53 
 
 
286 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0969  hypothetical protein  29.69 
 
 
271 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4390  transcriptional regulator-like protein  24.81 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4998  transcriptional regulator-like protein  26.4 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>