22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0297 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0297  hypothetical protein  100 
 
 		 273 aa  544  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2491  UspA domain protein  52.01 
 
 		 273 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2089  UspA domain protein  51.64 
 
 		 298 aa  251  6e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2161  UspA domain-containing protein  47.08 
 
 		 280 aa  231  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.551312  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2124  hypothetical protein  40.81 
 
 		 284 aa  194  9e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00183225 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1921  UspA domain protein  39.71 
 
 		 290 aa  179  5.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0824  UspA domain protein  32.01 
 
 		 288 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0929025  normal  0.400518 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1928  hypothetical protein  31.01 
 
 		 263 aa  102  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.101794  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1516  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  0.6745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1016  UspA domain-containing protein  31.61 
 
 		 293 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0741  hypothetical protein  37.63 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.560909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  26.89 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.37 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  37.04 
 
 		 415 aa  45.8  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  30.77 
 
 		 169 aa  45.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.38 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1718  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 291 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  25.68 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2815  UspA domain protein  26.25 
 
 		 147 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0183337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  27.27 
 
 		 148 aa  42.4  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0641  UspA domain-containing protein  26.32 
 
 		 314 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.562028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>