11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3929 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3929  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 407 aa  838    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4551  FG-GAP repeat protein  33.1 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.728727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6276  hypothetical protein  33.95 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  30.87 
 
 		 1838 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1785  FG-GAP repeat protein  28.39 
 
 		 413 aa  52.4  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.320028  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1655  FG-GAP repeat-containing protein  26.59 
 
 		 389 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418657  normal  0.573557 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4537  FG-GAP repeat-containing protein  21.35 
 
 		 402 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.578932 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  23.18 
 
 		 895 aa  50.4  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05280  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 		 849 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.392143  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6339  FG-GAP repeat protein  19.75 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3417  esterase  28.66 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>