22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3635 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3635  hypothetical protein  100 
 
 
825 aa  1649    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4421  hypothetical protein  25.91 
 
 
717 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3177  hypothetical protein  24.11 
 
 
703 aa  102  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4400  hypothetical protein  25.91 
 
 
717 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2723  hypothetical protein  25.87 
 
 
710 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587118  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4420  hypothetical protein  26.97 
 
 
720 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4265  double-transmembrane region  24.4 
 
 
717 aa  91.3  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.837829  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1803  hypothetical protein  23.16 
 
 
773 aa  79.3  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3186  hypothetical protein  22.77 
 
 
682 aa  73.9  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0135  hypothetical protein  34.86 
 
 
660 aa  61.6  0.00000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1794  hypothetical protein  22.7 
 
 
677 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.918529  normal  0.567603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1415  hypothetical protein  40.91 
 
 
933 aa  55.8  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5768  hypothetical protein  25.16 
 
 
684 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0366246  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2312  hypothetical protein  32.11 
 
 
872 aa  53.5  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1322  hypothetical protein  37.5 
 
 
397 aa  51.6  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.944811  normal  0.143709 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6144  hypothetical protein  25.32 
 
 
724 aa  51.2  0.00008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0134099  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0206  hypothetical protein  23.66 
 
 
688 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.277086  normal  0.243086 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2682  hypothetical protein  25 
 
 
687 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.360755 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0722  hypothetical protein  25.44 
 
 
696 aa  48.9  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.440908  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2092  hypothetical protein  31.17 
 
 
373 aa  48.5  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639043  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08051  inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H2-like protein, precursor  30.1 
 
 
641 aa  48.1  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.158508  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0912  hypothetical protein  21.56 
 
 
687 aa  46.2  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.385039  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>