More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2565 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  100 
 
 		 78 aa  146  9e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 74 aa  94.7  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  60.26 
 
 		 78 aa  93.2  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0643  acyl carrier protein  62.86 
 
 		 77 aa  88.6  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000166271  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  65.22 
 
 		 75 aa  88.6  3e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  61.04 
 
 		 78 aa  87.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  65.28 
 
 		 80 aa  87  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  60 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 80 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 82 aa  86.7  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 79 aa  86.3  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  63.89 
 
 		 103 aa  85.5  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 79 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 79 aa  84.7  3e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  57.89 
 
 		 78 aa  84.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 78 aa  84  6e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  84  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 79 aa  84  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  58.82 
 
 		 77 aa  83.6  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5650  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.611546  normal  0.225397 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  60.27 
 
 		 81 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1181  acyl carrier protein  56 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185913  decreased coverage  0.00116588 
 
 
-
 
NC_002620  TC0507  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0583644  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0605  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  9.329130000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  62.5 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2043  acyl carrier protein  56.58 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000099502  decreased coverage  0.00468408 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0196  acyl carrier protein  51.95 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  59.42 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1664  Acyl carrier protein (ACP)  56.58 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0513886  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2623  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188634  unclonable  0.0000000000890491 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2493  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000155434  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3799  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181664  normal  0.777832 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  58.33 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2292  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000308066  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  56 
 
 		 76 aa  81.6  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1500  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000077006  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  61.11 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  55.26 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3816  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.50375e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1915  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00426402  unclonable  0.000000216154 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1661  acyl carrier protein  53.25 
 
 		 79 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  58.82 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0166  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.317698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 77 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  60.87 
 
 		 77 aa  80.9  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  58.9 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5269  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3277  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.796037  normal  0.660207 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2630  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1216  acyl carrier protein  61.33 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.729885  normal  0.686684 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1186  acyl carrier protein  53.95 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.026536 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  52.63 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0510  acyl carrier protein  52.78 
 
 		 77 aa  80.5  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1580  acyl carrier protein  56 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000805484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>