39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0539 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0539  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  100 
 
 		 232 aa  470  1e-132  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2520  Redoxin domain protein  29.03 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5111  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.63 
 
 		 231 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.186227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0183  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  31.74 
 
 		 164 aa  61.2  0.00000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.144307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1203  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  26.51 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00883654  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5433  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  30.72 
 
 		 208 aa  53.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3671  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.93 
 
 		 148 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0274  redoxin  27.43 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0829  1-Cys peroxiredoxin  26.88 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.456456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0359  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.78 
 
 		 166 aa  49.3  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4049  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.44 
 
 		 188 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2665  hypothetical protein  29.7 
 
 		 223 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5059  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  23.61 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0414  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.48 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.388606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3069  redoxin domain-containing protein  23.21 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1410  peroxidase  27.78 
 
 		 212 aa  45.8  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5141  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.49 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.301686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1128  redoxin  27.4 
 
 		 152 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.138715  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.17 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.527569  normal  0.0758496 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0885  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.29 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5154  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  29.44 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4601  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.21 
 
 		 213 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0759  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.88 
 
 		 154 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.631395  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0525  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.56 
 
 		 178 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000136072  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0382  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  28.4 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0709659  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1413  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.49 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0354394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2242  Peroxiredoxin  26.67 
 
 		 217 aa  43.5  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1954  thioredoxin  25.2 
 
 		 184 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4100  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  33.6 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5164  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.91 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.279862  normal  0.954313 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1402  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.33 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0234  redoxin  23.78 
 
 		 183 aa  42.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.436013 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2933  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  25.75 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2815  redoxin domain-containing protein  27.06 
 
 		 214 aa  42.4  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6901  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.67 
 
 		 156 aa  42.4  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0101292  normal  0.378229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3908  hypothetical protein  20.67 
 
 		 186 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2023  putative thiol-specific antioxidant protein  22.7 
 
 		 178 aa  42.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384387  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0124  helix-turn-helix, Fis-type  23.38 
 
 		 217 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.490683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0547  peroxiredoxin-like protein  27.41 
 
 		 168 aa  42  0.008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>