More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2016 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  690    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.39 
 
 
310 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.37 
 
 
296 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.13 
 
 
296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.96 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.58 
 
 
300 aa  178  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.89 
 
 
298 aa  178  1e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  38.85 
 
 
318 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.26 
 
 
301 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.04 
 
 
299 aa  173  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.83 
 
 
316 aa  172  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.69 
 
 
302 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  36.43 
 
 
335 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.58 
 
 
347 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.33 
 
 
322 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.7 
 
 
318 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.68 
 
 
296 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.08 
 
 
293 aa  166  4e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.64 
 
 
306 aa  166  5e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.15 
 
 
320 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.96 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.97 
 
 
312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.68 
 
 
308 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.8 
 
 
297 aa  163  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  34.94 
 
 
321 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  37.31 
 
 
320 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  35.46 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  35.46 
 
 
321 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  35.46 
 
 
321 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  35.46 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  35.94 
 
 
306 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  35.46 
 
 
321 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  35.46 
 
 
315 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.71 
 
 
300 aa  160  4e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.9 
 
 
347 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.3 
 
 
277 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.15 
 
 
320 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.84 
 
 
320 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.84 
 
 
320 aa  156  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.48 
 
 
320 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  37.55 
 
 
317 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.87 
 
 
325 aa  152  8e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.87 
 
 
298 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.93 
 
 
299 aa  151  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.05 
 
 
297 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.16 
 
 
294 aa  149  6e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.63 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  37.66 
 
 
321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  31.73 
 
 
308 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.77 
 
 
303 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4007  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.8 
 
 
306 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.7 
 
 
309 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  34.25 
 
 
297 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.57 
 
 
304 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  33.48 
 
 
561 aa  140  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.74 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.12 
 
 
311 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  35.35 
 
 
321 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.62 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.48 
 
 
354 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  35.44 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.44 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.69 
 
 
298 aa  136  6.0000000000000005e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13101  acetyl-hydrolase/esterase lipR  31.8 
 
 
308 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2129  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  32.05 
 
 
417 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.33 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3012  esterase, putative  30.84 
 
 
303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.33 
 
 
318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.63 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.47 
 
 
297 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  33.48 
 
 
304 aa  131  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1377  esterase/lipase-like protein  28.21 
 
 
341 aa  129  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.25 
 
 
361 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  32.31 
 
 
335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.16 
 
 
303 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  34.22 
 
 
309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0843  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.27 
 
 
370 aa  126  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00573007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  34.14 
 
 
349 aa  126  5e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  32.4 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  28.97 
 
 
300 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF04570  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 
746 aa  123  4e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.611345  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0451  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.64 
 
 
298 aa  123  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.99 
 
 
323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1026  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.22 
 
 
423 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1867  alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  28.98 
 
 
326 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.644225 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1094  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.34 
 
 
335 aa  120  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0229836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.2 
 
 
320 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.21 
 
 
396 aa  118  9.999999999999999e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  30.66 
 
 
323 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.87 
 
 
372 aa  119  9.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.13 
 
 
328 aa  115  6.9999999999999995e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3441  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  31.2 
 
 
358 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19666  normal  0.282195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3243  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33 
 
 
326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.539162  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0557  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  28.75 
 
 
355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3228  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.47 
 
 
331 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.42 
 
 
303 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0489  Alpha/beta hydrolase  31.6 
 
 
348 aa  110  5e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3232  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.87 
 
 
336 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>