More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0611 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0611  co-chaperonin GroES  100 
 
 		 105 aa  204  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.506455  normal  0.35889 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2504  co-chaperonin GroES  80.77 
 
 		 104 aa  173  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  82.69 
 
 		 104 aa  173  8e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4265  chaperonin Cpn10  77.88 
 
 		 104 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228969  normal  0.0528982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  75.96 
 
 		 104 aa  163  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2191  co-chaperonin GroES  76.19 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  76.19 
 
 		 105 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  75 
 
 		 104 aa  161  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  75.24 
 
 		 105 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3171  co-chaperonin GroES  72.38 
 
 		 105 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.50399  normal  0.859314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2114  co-chaperonin GroES  73.08 
 
 		 104 aa  158  3e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  80.85 
 
 		 95 aa  157  4e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  81.72 
 
 		 98 aa  156  7e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 96 aa  156  7e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  67.31 
 
 		 104 aa  156  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  79.79 
 
 		 95 aa  156  8e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 96 aa  156  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1177  co-chaperonin GroES  70.48 
 
 		 105 aa  156  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.510717  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  73.08 
 
 		 104 aa  156  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  79.79 
 
 		 95 aa  156  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  69.23 
 
 		 104 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  155  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  68.27 
 
 		 104 aa  155  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  78.72 
 
 		 95 aa  155  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  79.79 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3033  co-chaperonin GroES  69.23 
 
 		 104 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.960902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  78.72 
 
 		 95 aa  154  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  78.49 
 
 		 98 aa  154  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  78.49 
 
 		 98 aa  154  4e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 95 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  67.31 
 
 		 104 aa  153  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2593  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 105 aa  152  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.458654  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 98 aa  152  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  74.74 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 98 aa  152  2e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  77.66 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 98 aa  151  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  76.6 
 
 		 121 aa  151  2.9999999999999998e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  77.42 
 
 		 98 aa  151  4e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0272  co-chaperonin GroES  76.34 
 
 		 96 aa  150  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 98 aa  150  5e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 98 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  78.72 
 
 		 98 aa  150  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 98 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  77.42 
 
 		 98 aa  149  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  74.47 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  73.4 
 
 		 98 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 95 aa  148  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  71.28 
 
 		 96 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  75.53 
 
 		 95 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  74.47 
 
 		 95 aa  148  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  76.6 
 
 		 98 aa  147  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  66.99 
 
 		 103 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2520  chaperone Hsp10, part of GroE chaperone system  73.4 
 
 		 95 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.691961  normal  0.971453 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2190  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 95 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4586  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 95 aa  144  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.480478 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0552  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  143  9e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2310  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0984  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 95 aa  143  9e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0092  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000241636  normal  0.390298 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0639  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00560672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0540  co-chaperonin GroES  69.79 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1043  chaperonin Cpn10  66.67 
 
 		 105 aa  141  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  69.47 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0596  co-chaperonin GroES  71.28 
 
 		 95 aa  141  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.474477  normal  0.0912075 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  72.34 
 
 		 95 aa  140  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0425  co-chaperonin GroES  70.21 
 
 		 96 aa  140  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  1.1607099999999999e-20  hitchhiker  0.002869 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0161  chaperonin Cpn10  71.58 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327073  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  68.09 
 
 		 95 aa  139  9e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0427  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  139  9e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0874691  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0700  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.210155  normal  0.0126966 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0438  co-chaperonin GroES  66.67 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000705596  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2345  co-chaperonin GroES  68.75 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.0000000286758  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0678  co-chaperonin GroES  64.21 
 
 		 96 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.651132  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 95 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2529  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0262789 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0482  co-chaperonin GroES  65.96 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2002  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0699  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.0000000127096  unclonable  0.0000000000292135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3176  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.521457  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1864  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563369  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3154  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0658  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000000933767  decreased coverage  0.00156326 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3118  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143414  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1457  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0543  co-chaperonin GroES  67.37 
 
 		 96 aa  137  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00172283  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2741  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.260788  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0732  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138377  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0749  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0685029 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0911  co-chaperonin GroES  63.54 
 
 		 97 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.740154  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3954  co-chaperonin GroES  64.58 
 
 		 97 aa  137  6e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000645476  normal  0.0983553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2334  co-chaperonin GroES  65.26 
 
 		 96 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0638712  normal  0.0156201 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1519  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013656  normal  0.699142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0760  co-chaperonin GroES  66.32 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000383794  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>