37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1003 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1003    100 
 
 
374 bp  741    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.539082  hitchhiker  0.000396797 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2016    92.73 
 
 
344 bp  396  1e-108  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00979161 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0801  hypothetical protein  87.93 
 
 
384 bp  178  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000336215 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0862  hypothetical protein  87.93 
 
 
384 bp  178  7e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.106662 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0288  transposase, IS605 OrfB  86.43 
 
 
1263 bp  129  6e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.125775  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1840  transposase, IS605 OrfB  90.36 
 
 
1260 bp  101  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.113531  hitchhiker  0.00220366 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1064  transposase, IS605 OrfB  90.36 
 
 
1458 bp  101  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1390  transposase, IS605 OrfB  85.71 
 
 
1383 bp  89.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0641  paREP12  87.1 
 
 
270 bp  89.7  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.000929061  hitchhiker  0.00106451 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1720  transposase, IS605 OrfB  86.46 
 
 
1266 bp  87.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.720564  normal  0.119776 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1279  transposase, IS605 OrfB  84.21 
 
 
1272 bp  85.7  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1818    89.19 
 
 
282 bp  83.8  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.661464  hitchhiker  0.000000259029 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1099    85.71 
 
 
536 bp  83.8  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.928435  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1262  transposase, IS605 OrfB  88.16 
 
 
816 bp  79.8  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0005  transposase, IS605 OrfB  85.42 
 
 
1281 bp  79.8  0.0000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.741123  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1447  transposase, IS605 OrfB  85.26 
 
 
1332 bp  77.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.303185  normal  0.469752 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1263    86.75 
 
 
288 bp  77.8  0.000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1059  transposase, IS605 OrfB  83.81 
 
 
480 bp  73.8  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1382  transposase, IS605 OrfB  84.38 
 
 
1206 bp  71.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1227  transposase, IS605 OrfB  84.38 
 
 
1224 bp  71.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.666406  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1242  Fis family transcriptional regulator  84.21 
 
 
885 bp  69.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.635409  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0282  transposase, IS605 OrfB  84.44 
 
 
438 bp  69.9  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0548229  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1046  transposase, IS605 OrfB  97.37 
 
 
522 bp  67.9  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0261063 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1462  transposase, IS605 OrfB  87.1 
 
 
1266 bp  60  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1707  transposase IS605 OrfB  90 
 
 
1263 bp  60  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00115032 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1007  hypothetical protein  94.74 
 
 
276 bp  60  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0572948  hitchhiker  0.0000560019 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1333  IS605 family transposase OrfB  92.5 
 
 
1434 bp  56  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1033  transposase, IS605 OrfB  88.46 
 
 
1323 bp  56  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000000086107 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0158  transposase, IS605 OrfB  90.91 
 
 
237 bp  56  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0122    86.15 
 
 
4039 bp  52  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.44906  normal  0.010671 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0124  transposase IS605 OrfB  86.15 
 
 
1254 bp  52  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00276741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1380    93.94 
 
 
156 bp  50.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.638331  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1771    88.89 
 
 
213 bp  50.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1179  transposase, IS605 OrfB  85.71 
 
 
1251 bp  48.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1030  transposase, IS605 OrfB  96.43 
 
 
291 bp  48.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000000000210924 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0333  transposase, IS605 OrfB  96.43 
 
 
1257 bp  48.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.107927  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1731  transposase, IS605 OrfB  88.37 
 
 
981 bp  46.1  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>