24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1693 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1693    100 
 
 		 1055 bp  2091    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.514185  normal  0.247616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0324    82.13 
 
 		 1072 bp  157  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2502    85.56 
 
 		 1090 bp  151  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.674339  normal  0.0724762 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1695    93.26 
 
 		 1086 bp  129  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.165602  normal  0.365956 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2002    92.71 
 
 		 756 bp  129  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.923889 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1848  hypothetical protein  83.75 
 
 		 984 bp  111  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4132  hypothetical protein  83.12 
 
 		 984 bp  103  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1903    84.51 
 
 		 294 bp  99.6  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.475323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1891  hypothetical protein  83.8 
 
 		 282 bp  91.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0968577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0907  hypothetical protein  84.75 
 
 		 984 bp  91.7  4e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0248219  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1111  hypothetical protein  83.46 
 
 		 984 bp  89.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1385  hypothetical protein  80 
 
 		 984 bp  85.7  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.868466  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1948  hypothetical protein  81.25 
 
 		 984 bp  79.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.557873  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1735  hypothetical protein  89.39 
 
 		 984 bp  75.8  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1902  hypothetical protein  84.16 
 
 		 444 bp  73.8  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.266524  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2822    91.23 
 
 		 526 bp  73.8  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.348547  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4372    89.47 
 
 		 808 bp  65.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3676    87.69 
 
 		 1107 bp  65.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3757  hypothetical protein  81.75 
 
 		 189 bp  65.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3677    87.69 
 
 		 902 bp  65.9  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2823  hypothetical protein  86.11 
 
 		 270 bp  63.9  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.379553  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1890  hypothetical protein  87.1 
 
 		 444 bp  60  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0896786  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3356  hypothetical protein  86.79 
 
 		 972 bp  50.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526564  normal  0.864241 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1892  hypothetical protein  85.71 
 
 		 150 bp  48.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0469507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>