10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3052 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3052  Outer membrane protein  100 
 
 		 417 aa  856    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000151866  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3070  Outer membrane protein-like protein  67.18 
 
 		 415 aa  555  1e-157  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000236485  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6822  Outer membrane protein-like protein  49.24 
 
 		 441 aa  392  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6877  Outer membrane protein-like protein  48.73 
 
 		 453 aa  381  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1503  hypothetical protein  37.35 
 
 		 423 aa  250  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0204458  normal  0.0287223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2435  outer membrane efflux protein  19.85 
 
 		 438 aa  63.2  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0863  outer membrane efflux protein  22.11 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0886206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2166  outer membrane efflux protein  22.38 
 
 		 423 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2056  outer membrane efflux protein  21.9 
 
 		 423 aa  50.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000544389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2548  outer membrane efflux protein  21.07 
 
 		 408 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>