17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1097 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1097  YD repeat protein  100 
 
 		 1229 aa  2515    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.791752  unclonable  0.0000000000274764 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1049  YD repeat protein  27.65 
 
 		 1084 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4144  YD repeat protein  26.39 
 
 		 1092 aa  228  5.0000000000000005e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.794308  normal  0.283099 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1394  YD repeat protein  24.92 
 
 		 1129 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2121  YD repeat protein  28.55 
 
 		 1837 aa  179  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0873035  normal  0.943874 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3006  YD repeat protein  26 
 
 		 1263 aa  174  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2667  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1152 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3730  YD repeat-containing protein  26.69 
 
 		 1152 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0100146  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3186  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1079 aa  122  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150052  normal  0.187937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4640  hypothetical protein  23.41 
 
 		 1322 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.963654  normal  0.0174413 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4387  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1056 aa  107  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.95296  hitchhiker  0.00457818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7100  YD repeat protein  24.69 
 
 		 1065 aa  86.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2075  YD repeat protein  27.02 
 
 		 1129 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1521  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1807 aa  53.1  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442861  normal  0.0305188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  42.65 
 
 		 2395 aa  51.6  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4791  PA14 domain protein  32.17 
 
 		 2252 aa  50.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.45455  normal  0.215304 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0601  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1857 aa  50.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.850446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>