59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0233 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0233  protein of unknown function DUF95 transmembrane  100 
 
 		 318 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4959  protein of unknown function DUF95 transmembrane  53.5 
 
 		 315 aa  351  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000637265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1683  protein of unknown function DUF95 transmembrane  56.09 
 
 		 327 aa  330  1e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09283  hypothetical protein  51.26 
 
 		 324 aa  329  3e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.481301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2232  hypothetical protein  46.39 
 
 		 324 aa  292  5e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0377235  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2133  hypothetical protein  44.83 
 
 		 603 aa  289  5.0000000000000004e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3215  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.21 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0604768  normal  0.220774 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3801  hypothetical protein  27.36 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56110  hypothetical protein  28.15 
 
 		 326 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4888  hypothetical protein  26.9 
 
 		 326 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.32174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1082  hypothetical protein  26.82 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3844  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.13 
 
 		 330 aa  90.1  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0410  hypothetical protein  25.69 
 
 		 342 aa  89.4  8e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.65934  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3743  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26 
 
 		 332 aa  89  9e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.358562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3317  hypothetical protein  26.65 
 
 		 328 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945777 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4440  integral membrane protein  24.38 
 
 		 325 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.627062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4050  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.67 
 
 		 331 aa  85.5  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4811  hypothetical protein  24.01 
 
 		 321 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00997057  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1334  hypothetical protein  21.91 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4022  integral membrane protein  26.51 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.96338  normal  0.0627299 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3912  integral membrane protein  24.07 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00542014  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2278  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.48 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7600  protein of unknown function DUF95 transmembrane  24.19 
 
 		 333 aa  77  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0773481  normal  0.0891448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4267  hypothetical protein  27.34 
 
 		 335 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000574123  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2676  hypothetical protein  36.75 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20720  uncharacterized membrane protein  25.45 
 
 		 331 aa  73.6  0.000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.04898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1613  hypothetical protein  23.91 
 
 		 337 aa  72.4  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0233991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5852  hypothetical protein  23.26 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.699479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2502  putative integral membrane protein  23.91 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0756  hypothetical protein  25.59 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.495478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3128  protein of unknown function DUF95 transmembrane  20.56 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.423002 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1202  integral membrane protein  21.84 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.525523  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38340  hypothetical protein  25.6 
 
 		 325 aa  64.3  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.5603  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09270  uncharacterized membrane protein  25.91 
 
 		 329 aa  63.2  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.130747 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4318  integral membrane protein  25.31 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.416523  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2338  protein of unknown function DUF95 transmembrane  31.25 
 
 		 329 aa  62.4  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00579329  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1272  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.17 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000243278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2368  protein of unknown function DUF95 transmembrane  33.33 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5458  hypothetical protein  20.68 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.812891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13725  transmembrane protein  20.82 
 
 		 330 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.258744  normal  0.61477 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1835  protein of unknown function DUF95 transmembrane  32.28 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.920974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2521  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.43 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.626612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3829  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.55 
 
 		 332 aa  57.8  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157843  normal  0.011447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1404  membrane protein-like protein  20.95 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.101194 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4823  protein of unknown function DUF95 transmembrane  27.39 
 
 		 331 aa  57  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1813  hypothetical protein  32.82 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0049  protein of unknown function DUF95 transmembrane  29.08 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000020033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3575  protein of unknown function DUF95 transmembrane  23.08 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.330018  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0462  hypothetical protein  23.67 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.723266  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2967  hypothetical protein  31.03 
 
 		 347 aa  53.1  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.597824  normal  0.0170262 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0843  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  52.8  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.100965  normal  0.175405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5230  hypothetical protein  22.11 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.230023  normal  0.753806 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4951  hypothetical protein  22.11 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4862  hypothetical protein  22.11 
 
 		 330 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1962  hypothetical protein  31.69 
 
 		 197 aa  48.5  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.923141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1074  hypothetical protein  32.17 
 
 		 196 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3166  protein of unknown function DUF95 transmembrane  30.15 
 
 		 509 aa  45.8  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1789  protein of unknown function DUF95 transmembrane  26.29 
 
 		 754 aa  44.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.482085 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0946  protein of unknown function DUF95 transmembrane  28.23 
 
 		 188 aa  42.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.886954  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>