40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2623 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2623  hypothetical protein  100 
 
 		 86 aa  181  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2631  hypothetical protein  34.88 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.064289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1503  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.269876  normal  0.337575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0995  hypothetical protein  48.08 
 
 		 86 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2867  hypothetical protein  38.54 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3494  hypothetical protein  45.31 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.626727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3189  hypothetical protein  41.03 
 
 		 79 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.707769  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2277  hypothetical protein  45.31 
 
 		 86 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.768372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2434  hypothetical protein  45.07 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5705  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929828  normal  0.279454 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48330  hypothetical protein  36.59 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0629623  normal  0.0634515 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15330  hypothetical protein  44.64 
 
 		 85 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2087  hypothetical protein  40 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0234  hypothetical protein  41.25 
 
 		 86 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374054  normal  0.278389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2009  hypothetical protein  30.86 
 
 		 91 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1910  hypothetical protein  29.63 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.216099 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5376  hypothetical protein  43.86 
 
 		 110 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.290226 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1112  hypothetical protein  35.37 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.238884 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5185  hypothetical protein  36.49 
 
 		 110 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.519689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3291  hypothetical protein  40 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.772409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0012  hypothetical protein  38.6 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.383277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0010  hypothetical protein  38.6 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000597864  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2213  hypothetical protein  34.85 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0475545  normal  0.961579 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52960  hypothetical protein  31.03 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0010  hypothetical protein  38.6 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.430167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3619  hypothetical protein  41.38 
 
 		 110 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.100113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1332  hypothetical protein  30.95 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.186135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4557  hypothetical protein  30.95 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3370  hypothetical protein  38.89 
 
 		 78 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1427  hypothetical protein  31.65 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0853542  normal  0.792508 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3857  hypothetical protein  30.95 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4488  hypothetical protein  31.65 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4064  hypothetical protein  29.41 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3993  hypothetical protein  31.65 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0652505  normal  0.145213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4640  hypothetical protein  36.54 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2404  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3777  hypothetical protein  30.86 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.26386  hitchhiker  0.000401061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1824  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.111076  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49370  hypothetical protein  37.31 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3573  hypothetical protein  30.59 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>