27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1467 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_1467  YgfB and YecA  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4517  hypothetical protein  87.18 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.301076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3806  yecA family protein  86.15 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  hitchhiker  0.00000393308 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4023  yecA family protein  87.18 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0158141 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1394  yecA family protein  87.18 
 
 		 195 aa  345  2e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3739  hypothetical protein  91.28 
 
 		 195 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.144928  normal  0.012413 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1643  hypothetical protein  90.26 
 
 		 195 aa  331  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45840  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3889  hypothetical protein  76.92 
 
 		 195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.370714  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1811  yecA family protein  82.56 
 
 		 195 aa  308  4e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32810  metal-binding protein  78.76 
 
 		 195 aa  254  5e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.225261  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2227  yecA family protein  42.7 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.802171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0863  YgfB and YecA  41.21 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2143  YgfB and YecA  35.43 
 
 		 185 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1854  hypothetical protein  35.09 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.988982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1877  yecA family protein  31.46 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2181  hypothetical protein  32.09 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1894  YgfB and YecA  27.75 
 
 		 432 aa  62.4  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00737905  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0113  yecA family protein  29.21 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000620345  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2102  yecA family protein  32.24 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  27.27 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0645  YecA family protein  26.13 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.663243  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0060  yecA family protein  28.37 
 
 		 237 aa  48.5  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0914  yecA family protein  24.86 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0115  yecA family protein  27.11 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410021  hitchhiker  0.00793411 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4194  yecA family protein  25.61 
 
 		 221 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000432994 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1156  yecA family protein  24.32 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.324064 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>