20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0738 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0738  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  779    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.677838  normal  0.0727241 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0012  hypothetical protein  70.09 
 
 		 375 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0170  DNA sulfur modification protein DndB  55.5 
 
 		 372 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2473  hypothetical protein  50.83 
 
 		 358 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1367  DNA sulfur modification protein DndB  46.15 
 
 		 380 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0472  hypothetical protein  45.94 
 
 		 361 aa  333  4e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2305  hypothetical protein  44.39 
 
 		 369 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.468851  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0360  hypothetical protein  46.42 
 
 		 380 aa  323  3e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.102743  decreased coverage  0.00986478 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0834  hypothetical protein  43.68 
 
 		 364 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4573  hypothetical protein  44.51 
 
 		 370 aa  301  1e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.278248  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0746  hypothetical protein  40.45 
 
 		 355 aa  265  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000170562  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4837  DGQHR domain protein  50.7 
 
 		 249 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.564526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2571  hypothetical protein  26.39 
 
 		 354 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000749327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3403  hypothetical protein  25.83 
 
 		 354 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00088344 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1849  hypothetical protein  25.56 
 
 		 354 aa  116  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00226909  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2404  DGQHR domain protein  22.98 
 
 		 422 aa  86.3  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3764  DGQHR domain protein  22.09 
 
 		 409 aa  65.1  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4839  DGQHR domain protein  22.19 
 
 		 391 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7558  hypothetical protein  26.18 
 
 		 408 aa  48.9  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2460  DGQHR domain protein  21.23 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0189337 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>