More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4971 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008688  Pden_4971  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
487 aa  981    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5602  aldehyde dehydrogenase  70.02 
 
 
487 aa  674    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2908  Aldehyde Dehydrogenase  74.13 
 
 
487 aa  696    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.491333  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5026  Betaine-aldehyde dehydrogenase  72.48 
 
 
487 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985059 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5673  aldehyde dehydrogenase  70.8 
 
 
476 aa  680    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1545  Aldehyde Dehydrogenase  66.94 
 
 
487 aa  632  1e-180  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678495  normal  0.589587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1492  aldehyde dehydrogenase  59.02 
 
 
492 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00734873 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0773  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.67 
 
 
518 aa  533  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781579  normal  0.7194 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6594  aldehyde dehydrogenase  58.64 
 
 
492 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.596939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3077  aldehyde dehydrogenase  54.73 
 
 
500 aa  518  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364593  normal  0.0549958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2938  aldehyde dehydrogenase  57.17 
 
 
490 aa  514  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0055  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.19 
 
 
498 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.103268  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03900  aldehyde dehydrogenase (alddh), putative  39.54 
 
 
506 aa  351  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.72 
 
 
498 aa  347  4e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  40.22 
 
 
490 aa  345  1e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.08 
 
 
490 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2634  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 
494 aa  333  4e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.04 
 
 
496 aa  332  7.000000000000001e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2556  aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
494 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.271873  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2504  Aldehyde Dehydrogenase  39.06 
 
 
497 aa  330  4e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.98157  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
489 aa  330  4e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4856  aldehyde dehydrogenase  42.56 
 
 
483 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263653  normal  0.221142 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4511  betaine aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
489 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.72 
 
 
503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2860  aldehyde dehydrogenase  39.53 
 
 
494 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2591  aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2882  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.75 
 
 
494 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2640  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
494 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.198513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2831  aldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 
494 aa  326  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.217262  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3102  aldehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
502 aa  326  5e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2450  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.32 
 
 
494 aa  326  6e-88  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2837  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.17 
 
 
494 aa  326  6e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2843  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.53 
 
 
494 aa  326  6e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128159  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  40.37 
 
 
501 aa  326  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3841  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.46 
 
 
508 aa  325  8.000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.829655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  39.35 
 
 
499 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
495 aa  324  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  38.67 
 
 
495 aa  323  4e-87  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.91 
 
 
490 aa  323  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.46 
 
 
488 aa  322  8e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2229  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  322  8e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.545234  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1836  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.422897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0376  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0191896  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1480  aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 
490 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0515859  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  39.75 
 
 
492 aa  322  9.999999999999999e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0915  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1427  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0180  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0467  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1924  betaine aldehyde dehydrogenase  41.72 
 
 
489 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00178825  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
488 aa  320  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  40.46 
 
 
488 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1073  betaine aldehyde dehydrogenase  41.92 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000506243  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  40.38 
 
 
488 aa  320  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.23 
 
 
504 aa  320  5e-86  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3577  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.84 
 
 
491 aa  318  1e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.162462  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11190  putative aldehyde dehydrogenase  42.74 
 
 
495 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1527  transposase, IS605 OrfB family  40.73 
 
 
421 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4241  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
498 aa  316  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
488 aa  316  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3572  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.12 
 
 
506 aa  315  9.999999999999999e-85  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.532115  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3348  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0219223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3313  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3263  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3562  aldehyde dehydrogenase (NAD)  38.02 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134581 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3609  aldehyde dehydrogenase  38.02 
 
 
494 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  42.62 
 
 
468 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6130  Betaine-aldehyde dehydrogenase  41.39 
 
 
492 aa  314  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3309  betaine aldehyde dehydrogenase  39.46 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  43 
 
 
501 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  38.65 
 
 
489 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3662  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.8 
 
 
494 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4700  aldehyde dehydrogenase  39.64 
 
 
483 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0199533 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1377  Aldehyde Dehydrogenase  41.15 
 
 
506 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162758  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05070  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH), putative  39.46 
 
 
524 aa  313  3.9999999999999997e-84  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0886  Aldehyde Dehydrogenase  39.12 
 
 
473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6072  aldehyde dehydrogenase  40.71 
 
 
488 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1691  aldehyde dehydrogenase  46.45 
 
 
494 aa  313  4.999999999999999e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6025  Aldehyde Dehydrogenase  41.15 
 
 
483 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.181581 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0958  aldehyde dehydrogenase  37.21 
 
 
492 aa  313  4.999999999999999e-84  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.938749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2306  aldehyde dehydrogenase  41.85 
 
 
497 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.445313  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  40.29 
 
 
488 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0554  betaine aldehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
489 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1655  aldehyde dehydrogenase (NAD)  37.8 
 
 
494 aa  312  7.999999999999999e-84  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0330388 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  42.48 
 
 
491 aa  312  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2290  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.41 
 
 
503 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.109533 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3569  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 
494 aa  311  1e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3257  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 
494 aa  312  1e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.536879  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  40.04 
 
 
510 aa  311  1e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3439  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.92 
 
 
493 aa  312  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.383483  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1028  putative aldehyde dehydrogenase  42.54 
 
 
495 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3586  aldehyde dehydrogenase  42.51 
 
 
501 aa  312  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.615905 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3537  betaine aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
489 aa  311  2e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5183  betaine aldehyde dehydrogenase  40.61 
 
 
489 aa  311  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
479 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2406  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
484 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0732  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  40.99 
 
 
501 aa  311  2e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.207318  normal  0.0607885 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00554  Aldehyde dehydrogenase (ALDDH)(ALDH)(EC 1.2.1.3) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08157]  41.01 
 
 
497 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.534945  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2474  aldehyde dehydrogenase  41.42 
 
 
497 aa  310  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>