25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4227 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4227  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  338  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2387  putative lipid carrier protein-like protein  49.34 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0557516 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0466  hypothetical protein  48.03 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.978743  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2118  hypothetical protein  48.03 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.130953  normal  0.854449 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3117  hypothetical protein  40.38 
 
 		 169 aa  91.3  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4477  hypothetical protein  41.22 
 
 		 181 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.320227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0291  hypothetical protein  40.44 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0267  hypothetical protein  40.44 
 
 		 174 aa  86.3  2e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.708651  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1002  hypothetical protein  41.22 
 
 		 181 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4327  hypothetical protein  39.69 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.457545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4780  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.472606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3004  putative lipid carrier protein-like protein  43.59 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2400  putative lipid carrier protein-like protein  36.07 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4295  putative lipid carrier protein-like  39.16 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6297  hypothetical protein  34.29 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3474  hypothetical protein  32.28 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.498948  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3493  putative lipid carrier protein-like protein  29.2 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0107  hypothetical protein  45.45 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02299  hypothetical protein  50 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.394497 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2134  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1787  hypothetical protein  31.33 
 
 		 141 aa  45.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.017366  normal  0.582265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2111  hypothetical protein  37.29 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.342906  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3585  hypothetical protein  43.48 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.837033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4662  hypothetical protein  43.48 
 
 		 138 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3090  sterol-binding domain-containing protein  44.64 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>