More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3526 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3526  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  866    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3146  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  64.27 
 
 		 436 aa  560  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299695  hitchhiker  0.0000446713 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10210  putative oxidoreductase  62.47 
 
 		 435 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.977198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4088  hypothetical protein  58.28 
 
 		 434 aa  501  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.454029  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1800  hypothetical protein  59.26 
 
 		 435 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1596  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  42.13 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3605  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  42.49 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3014  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  50.42 
 
 		 394 aa  289  5.0000000000000004e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152708  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1558  nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  37.44 
 
 		 458 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29430  nitrilotriacetate monooxygenase  37.86 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.64384  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1126  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.96 
 
 		 453 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1381  xenobiotic compound DszA family monooxygenase  33.41 
 
 		 440 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.559516  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4356  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.71 
 
 		 449 aa  228  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.191629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2676  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  35.01 
 
 		 448 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3292  nitrilotriacetate monooxygenase component A  36.03 
 
 		 447 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451548  normal  0.084467 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3283  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  36.11 
 
 		 474 aa  226  8e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4419  nitrilotriacetate monooxygenase  37.35 
 
 		 455 aa  226  8e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.332959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0200  hypothetical protein  33.5 
 
 		 434 aa  224  2e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1784  nitrilotriacetate monooxygenase component A  38.35 
 
 		 429 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.156784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1853  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.71 
 
 		 456 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1300  putative nitrilotriacetate monooxygenase  36.87 
 
 		 451 aa  218  1e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0896409  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3332  putative monooxygenase  36.21 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01780  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.41 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3282  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.27 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22400  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit protein  32.88 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3452  putative monooxygenase  36.26 
 
 		 447 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000752171 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4106  nitrilotriacetate monooxygenase  35.65 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2352  nitrilotriacetate monooxygenase, A subunit, putative  34.97 
 
 		 434 aa  212  9e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742121  normal  0.6128 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3188  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  34.5 
 
 		 446 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2568  nitrilotriacetate monooxygenase component A (NtA monooxygenase component A) (NtA-MO A)  34.42 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2658  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  32.35 
 
 		 439 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3854  putative monooxygenase  34.38 
 
 		 492 aa  208  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.436036  normal  0.791068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43930  monooxygenase, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  34.5 
 
 		 444 aa  206  5e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5176  monooxygenase  35.59 
 
 		 429 aa  206  8e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2409  hypothetical protein  36.13 
 
 		 454 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21340  xenobiotic compound monooxygenase, DszA family, A subunit  33.41 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.341615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8274  monooxygenase  36.64 
 
 		 442 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.104481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4307  putative nitrilotriacetate monooxygenase  35.19 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.355403  hitchhiker  0.00147548 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2529  putative monooxygenase  33.94 
 
 		 450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0160  putative monooxygenase  34.5 
 
 		 469 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7195  monooxygenase  32.72 
 
 		 443 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0485069  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05546  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  31.42 
 
 		 1121 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7232  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  32.49 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.177104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0268  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  32.88 
 
 		 448 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1849  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.58 
 
 		 452 aa  200  5e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.896869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1693  putative monooxygenase  34.06 
 
 		 449 aa  200  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0841245  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0906  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.33 
 
 		 441 aa  199  6e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457793  normal  0.708091 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6442  monooxygenase protein  32.1 
 
 		 451 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.01748 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4142  monooxygenase-like  32.39 
 
 		 454 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.279616  normal  0.0146609 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43950  monoxygenase, NtaA/DszA family  34.76 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.182023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4844  Nrd protein  33.49 
 
 		 448 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.426791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5962  nitrilotriacetate monooxygenase  31.11 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0150  putative monooxygenase  32.8 
 
 		 445 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.323467 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2283  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  33.1 
 
 		 440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.161392 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2156  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  33.73 
 
 		 458 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3862  flavin-dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 452 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691783  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1378  hypothetical protein  34.47 
 
 		 434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0574353  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3891  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  32.11 
 
 		 439 aa  196  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.68944  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4640  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  32.41 
 
 		 452 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1266  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  32.15 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.476784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1187  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2100  putative xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A, NtaA/SnaA/SoxA/DszA family  33.57 
 
 		 457 aa  195  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0395  putative monooxygenase  33.65 
 
 		 444 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4322  flavin-dependent oxidoreductase  34.53 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3435  Nrd protein  32.41 
 
 		 444 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.218631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4825  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  33.58 
 
 		 441 aa  194  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0738  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.97 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1550  putative nitrilotriacetate monooxygenase subunit A  32.5 
 
 		 451 aa  194  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.12121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2404  flavin-dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 440 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.878238  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2267  flavin-dependent oxidoreductase  33.97 
 
 		 440 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4354  putative nitrilotriacetate monooxygenase component  31.29 
 
 		 449 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1532  flavin-dependent oxidoreductase  33.73 
 
 		 450 aa  193  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.133839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2175  nitrilotriacetate monooxygenase component A  32.57 
 
 		 445 aa  193  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5875  flavin-dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 450 aa  193  7e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0866965  normal  0.229207 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4430  flavin-dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 450 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3936  flavin-dependent oxidoreductase  33.81 
 
 		 439 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.105146  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4213  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A protein  32.21 
 
 		 449 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1689  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.73 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.252883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0105  nitrilotriacetate monooxygenase component A  31.48 
 
 		 448 aa  192  1e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00568077 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0563  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.73 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1891  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.73 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1683  nitrilotriacetate monooxygenase component A  33.73 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2773  xenobiotic (desulfurization)monooxygenase subunit A  33.41 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4104  NtaA/SnaA/SoxA family monooxygenase  33.8 
 
 		 478 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.958651 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1731  putative EDTA monooxygenase  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.136958  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3311  Nrd protein  32.64 
 
 		 457 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0779  putative nitrilotriacetate monooxygenase  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000264103  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1847  putative EDTA monooxygenase  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00146661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2318  nitrilotriacetate monooxygenase component A  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6152  nitrilotriacetate monooxygenase protein, component A  33.49 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  hitchhiker  0.000273361 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2024  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  31.52 
 
 		 460 aa  191  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0518  putative EDTA monooxygenase  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.043498  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1639  putative EDTA monooxygenase  34.79 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0538792  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1369  luciferase-like protein  34.93 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2556  nitrilotriacetate monooxygenase component A  32.42 
 
 		 455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3116  Nrd protein  31.96 
 
 		 444 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6653  putative nitrilotriacetate monooxygenase component A  32.88 
 
 		 448 aa  190  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.743567  normal  0.503054 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2361  xenobiotic compound monooxygenase A subunit  31.67 
 
 		 441 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43651  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0232  putative monooxygenase  31.78 
 
 		 438 aa  189  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1255  nitrilotriacetate monooxygenase component A  35.16 
 
 		 468 aa  188  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>