More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2885 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_2885  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236188  normal  0.13112 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1146  serine O-acetyltransferase  75.68 
 
 
268 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2481  serine O-acetyltransferase  75.68 
 
 
268 aa  408  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2161  serine O-acetyltransferase  76.77 
 
 
269 aa  409  1e-113  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.446756  normal  0.714268 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1091  serine O-acetyltransferase  76.38 
 
 
268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.023292 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1648  serine O-acetyltransferase  73.33 
 
 
272 aa  396  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500904  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1075  serine O-acetyltransferase  74.02 
 
 
268 aa  394  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.128961  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2176  serine O-acetyltransferase  56.47 
 
 
276 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.585081  normal  0.724162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2624  serine O-acetyltransferase  56.03 
 
 
275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.174291  normal  0.141631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2401  serine O-acetyltransferase  56.15 
 
 
285 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2811  serine O-acetyltransferase  53.48 
 
 
285 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2579  serine O-acetyltransferase  56.47 
 
 
273 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3144  serine O-acetyltransferase  54.9 
 
 
275 aa  296  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.462561  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3752  serine O-acetyltransferase  57.54 
 
 
288 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.547192  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1262  serine acetyltransferase  53.33 
 
 
266 aa  293  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2135  serine O-acetyltransferase  52.43 
 
 
302 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.159333  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1568  serine O-acetyltransferase  51.76 
 
 
277 aa  292  5e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2542  serine acetyltransferase  50.58 
 
 
274 aa  291  1e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1113  serine O-acetyltransferase  50.58 
 
 
275 aa  290  1e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.860963 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3916  serine O-acetyltransferase  53.54 
 
 
275 aa  290  3e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.627699  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1729  serine O-acetyltransferase  51.33 
 
 
272 aa  289  4e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1926  serine O-acetyltransferase  52.16 
 
 
274 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.646269  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1224  serine acetyltransferase 4 (atsat-4) (atserat3;2)  52.16 
 
 
274 aa  288  7e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1765  serine O-acetyltransferase  50.98 
 
 
277 aa  288  8e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.465099  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3288  serine O-acetyltransferase  52.55 
 
 
286 aa  288  8e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0284698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2063  serine O-acetyltransferase  52.31 
 
 
286 aa  287  1e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03465  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0098  serine O-acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4980  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0101  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2387  serine O-acetyltransferase  52.69 
 
 
286 aa  286  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03416  hypothetical protein  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2111  serine O-acetyltransferase  52.69 
 
 
286 aa  286  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0298655 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4035  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3944  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.863552 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3819  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4111  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  286  2e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3917  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3898  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.205124 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4085  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4024  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  285  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3979  serine acetyltransferase  57.2 
 
 
273 aa  285  5.999999999999999e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.423159 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3774  serine O-acetyltransferase  54.33 
 
 
283 aa  285  9e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.511996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0128  serine acetyltransferase  56.35 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.25771  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1067  serine O-acetyltransferase  55.51 
 
 
274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1773  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5231  serine O-acetyltransferase  53.94 
 
 
275 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.026757  normal  0.11454 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3938  serine acetyltransferase  55.17 
 
 
273 aa  278  5e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1806  serine O-acetyltransferase  52.9 
 
 
269 aa  278  6e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.615997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4814  serine acetyltransferase  55.12 
 
 
273 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000193485 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4361  serine acetyltransferase  54.76 
 
 
273 aa  275  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4080  serine acetyltransferase  54.76 
 
 
273 aa  275  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1548  serine O-acetyltransferase  52.76 
 
 
264 aa  274  9e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000499697  hitchhiker  0.000167756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4136  serine acetyltransferase  55.16 
 
 
274 aa  274  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0172  serine acetyltransferase  55.16 
 
 
271 aa  274  1.0000000000000001e-72  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0080  serine acetyltransferase  54.76 
 
 
273 aa  273  3e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0074  serine acetyltransferase  54.76 
 
 
274 aa  273  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3299  serine acetyltransferase  49.61 
 
 
260 aa  273  3e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.800758  normal  0.368621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0181  serine acetyltransferase  54.41 
 
 
273 aa  272  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0880  serine O-acetyltransferase  52.57 
 
 
264 aa  271  7e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0926  serine O-acetyltransferase  51.18 
 
 
278 aa  271  9e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.354725  normal  0.148148 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002243  serine acetyltransferase  51.36 
 
 
273 aa  270  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00201  serine acetyltransferase  51.55 
 
 
268 aa  270  2e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.956846  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0211  serine O-acetyltransferase  50.78 
 
 
312 aa  269  4e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.248006  normal  0.21286 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0921  serine O-acetyltransferase  51.36 
 
 
264 aa  268  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0534835  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1084  Serine O-acetyltransferase  49.05 
 
 
277 aa  269  5e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.183103 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2225  serine acetyltransferase  53.6 
 
 
273 aa  268  8.999999999999999e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000564542  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1437  Serine O-acetyltransferase  50.79 
 
 
280 aa  266  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.798492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00125  serine acetyltransferase  51.36 
 
 
273 aa  266  2e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2800  serine acetyltransferase  51.36 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0933695  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0154  serine acetyltransferase  51.19 
 
 
265 aa  262  4e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0941  serine O-acetyltransferase  51.39 
 
 
272 aa  262  4.999999999999999e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4078  serine O-acetyltransferase  50.4 
 
 
259 aa  261  8e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4170  Serine O-acetyltransferase  51.38 
 
 
263 aa  261  1e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3208  serine O-acetyltransferase  50.39 
 
 
298 aa  257  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1336  serine O-acetyltransferase  50.18 
 
 
281 aa  256  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1176  serine O-acetyltransferase  50.18 
 
 
281 aa  256  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  0.057909 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0438  serine O-acetyltransferase  49.03 
 
 
266 aa  255  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3403  serine O-acetyltransferase  47.47 
 
 
272 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.280041  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87889  serine acetyl transferase  45.77 
 
 
374 aa  250  2e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4892  serine O-acetyltransferase  50 
 
 
280 aa  246  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0792  Serine O-acetyltransferase  48.06 
 
 
288 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.687147  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1551  serine O-acetyltransferase  50.18 
 
 
293 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.11379 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0527  Serine O-acetyltransferase  45.67 
 
 
288 aa  242  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0595  serine O-acetyltransferase  51.05 
 
 
283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182262 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4370  serine O-acetyltransferase  47.83 
 
 
282 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.844031  normal  0.0891787 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1429  serine O-acetyltransferase  50.58 
 
 
290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000018567 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0860  serine O-acetyltransferase  47.64 
 
 
274 aa  226  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0103482  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54880  putative serine acetyltransferase  51.87 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000008722  unclonable  5.80559e-22 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44289  predicted protein  42.53 
 
 
270 aa  219  3e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00762674 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_5580  predicted protein  45.04 
 
 
265 aa  211  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000587392  normal  0.0596868 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3685  serine O-acetyltransferase  47.08 
 
 
272 aa  206  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.189404 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46665  predicted protein  41.51 
 
 
539 aa  203  3e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.710949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3386  serine O-acetyltransferase  45.7 
 
 
272 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.224219 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1439  serine acetyltransferase protein  49.52 
 
 
271 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.247576  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23070  serine O-acetyltransferase  49.4 
 
 
242 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000574255  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2405  putative serine acetyltransferase  40.25 
 
 
263 aa  170  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3325  serine O-acetyltransferase  45.25 
 
 
222 aa  168  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000443093  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2066  serine O-acetyltransferase  49.69 
 
 
248 aa  167  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000110078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1260  serine O-acetyltransferase  50.6 
 
 
240 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000272502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2125  serine O-acetyltransferase  43.81 
 
 
309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.324489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>