22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2634 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2634  HNH endonuclease  100 
 
 		 110 aa  226  8e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.017055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0212  HNH nuclease  61.76 
 
 		 113 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.307481  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2025  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2062  HNH endonuclease  34.21 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0218324  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0356  HNH endonuclease  40 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0985  HNH endonuclease  40 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8187  HNH endonuclease  41.25 
 
 		 276 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3594  HNH endonuclease  27.17 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0621  HNH endonuclease  34.72 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0644  HNH endonuclease  37.88 
 
 		 102 aa  47.4  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0288065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2619  HNH endonuclease  30.67 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00254918  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8234  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0543214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5070  HNH endonuclease  44.12 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4083  HNH endonuclease  42.25 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3540  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 163 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2598  HNH endonuclease  32.5 
 
 		 127 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2069  HNH endonuclease  36.84 
 
 		 131 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185468 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1121  HNH endonuclease  32.56 
 
 		 178 aa  43.5  0.0009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  32.97 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0656  gp65  25.29 
 
 		 112 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1374  gp65  24.14 
 
 		 111 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0798155 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2705  gp65  25.29 
 
 		 111 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.271328  normal  0.759343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>