92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0907 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0907  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  100 
 
 		 92 aa  186  8e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.4481  normal  0.105235 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1343  Sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  79.66 
 
 		 74 aa  95.1  3e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.139725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1209  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  75 
 
 		 96 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3830  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  71.74 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3158 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3102  Sec-independent protein translocase TatE  71.74 
 
 		 63 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.101906  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1797  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  78.33 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00956825  normal  0.0641445 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1983  twin arginine-targeting protein translocase  77.97 
 
 		 70 aa  67.4  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.830772  normal  0.0374127 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2540  twin-arginine translocation system protein, TatA  76.27 
 
 		 70 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.540586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1199  twin arginine-targeting protein translocase  76.27 
 
 		 70 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0780596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1094  twin arginine-targeting protein translocase  43.28 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2183  twin arginine translocase protein A  39.74 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.487646  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2485  twin arginine translocase protein A  39.51 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.359725  normal  0.0181942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3708  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0454657  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3399  twin arginine translocase protein A  57.78 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3590  twin arginine translocase protein A  51.85 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.744358  normal  0.70676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1788  twin arginine translocase protein A  38.89 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4417  twin arginine translocase protein A  41.1 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.831215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2764  twin arginine translocase protein A  51.11 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0594411  normal  0.122404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1779  twin arginine translocase protein A  48.89 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00352153  hitchhiker  0.00879203 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2790  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 79 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0371592  normal  0.0561061 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1118  twin arginine-targeting protein translocase  43.33 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3189  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.681948  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2745  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.254475  normal  0.23521 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4219  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000534465 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4172  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121429 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4143  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4357  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4060  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4308  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5277  twin arginine translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.274389  normal  0.174664 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03678  hypothetical protein  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03729  twin arginate translocase protein A  35.71 
 
 		 89 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2513  twin arginine translocase protein A  46.67 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.640298  normal  0.431114 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2705  twin arginine translocase protein A  38.16 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3957  twin arginine translocase protein A  36 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0707519 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2067  twin arginine translocase protein A  40.68 
 
 		 59 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000287314  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2610  twin arginine-targeting protein translocase  36.17 
 
 		 93 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4235  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1806  twin arginine translocase protein A  41.27 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0839673  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2088  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000777407  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0524  twin arginine-targeting protein translocase  32.89 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.897575 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2242  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000411362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2026  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000580487  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2028  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2354  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108072  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2225  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000148535  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2272  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000018794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3099  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000374823  hitchhiker  2.75028e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2269  twin arginine translocase protein A  38.33 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.75681e-36 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3119  twin arginine-targeting protein translocase  56.76 
 
 		 74 aa  45.4  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0514819  normal  0.112278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3027  twin arginine-targeting protein translocase  43.33 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3554  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0589  twin arginine translocase protein A  41.82 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.905934 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0402  twin arginine-targeting protein translocase  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3760  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  33.77 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4360  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4204  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4181  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4300  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.111874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4253  twin arginine translocase protein A  34.21 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0016  twin arginine-targeting protein translocase  56.76 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2668  SEC-independent protein translocase protein  51.11 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.598915  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4202  Sec-independent protein translocase protein TatA  32.18 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3682  twin arginine-targeting protein translocase  35.82 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000036766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2869  Sec-independent protein translocase TatA  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.206339 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3376  twin arginine-targeting protein translocase  30.38 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0852423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4461  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  39.34 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.408951 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3638  Sec-independent protein translocase protein TatA  36.07 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3942  twin arginine-targeting protein translocase  36.07 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0274  twin arginine-targeting protein translocase TatA  36.07 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2789  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  31.65 
 
 		 88 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000447102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3912  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  30.38 
 
 		 84 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0503  twin arginine-targeting protein translocase  30.77 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0292  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  34.21 
 
 		 89 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.328055  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0152  mttA/Hcf106 family protein  41.67 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3515  twin arginine translocase protein A  31.33 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0856606  normal  0.226749 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2334  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.63 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.396798  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3898  twin arginine-targeting protein translocase  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0416  twin arginine-targeting protein translocase  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0442  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1671  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  32 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4244  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  40.35 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0428  twin arginine-targeting protein translocase  29.49 
 
 		 79 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041421 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3219  twin arginine translocase protein A  25 
 
 		 85 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.497525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1909  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 74 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.925772  normal  0.836766 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4407  twin arginine translocase protein A  62.07 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2999  twin arginine translocase protein A  30.77 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03791  twin arginine translocase protein A  28.89 
 
 		 95 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0925583  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3836  twin-arginine translocation protein, TatA/E family subunit  47.06 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.647162 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1646  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1673  twin arginine translocase protein A  32.76 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2872  twin arginine translocase protein A  22.39 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0548189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>