43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_2086 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1804  imelysin  91.7 
 
 
480 aa  901    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2145  hypothetical protein  69.41 
 
 
486 aa  664    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.952251  normal  0.195139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2086  hypothetical protein  100 
 
 
482 aa  997    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3326  hypothetical protein  42.22 
 
 
445 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.450324  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02715  hypothetical protein  42.72 
 
 
423 aa  332  8e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4939  hypothetical protein  44.29 
 
 
475 aa  330  3e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56830  metalloproteinase outer membrane  41.28 
 
 
446 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2833  putative iron-regulated protein A  41.63 
 
 
431 aa  326  5e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0600822  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0883  putative iron-regulated protein A  41.84 
 
 
435 aa  326  6e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.500561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1786  putative iron-regulated protein  42.72 
 
 
417 aa  322  9.999999999999999e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003123  iron-regulated protein A precursor  41.22 
 
 
420 aa  318  1e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37840  hypothetical protein  41.98 
 
 
441 aa  310  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00426998  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4475  hypothetical protein  40.84 
 
 
445 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0811777 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0952  hypothetical protein  41.31 
 
 
444 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0913  hypothetical protein  41.1 
 
 
443 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0979  hypothetical protein  41.01 
 
 
445 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000293825 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4488  hypothetical protein  41.09 
 
 
448 aa  297  4e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0248364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4061  iron-regulated protein A, putative  42.44 
 
 
458 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0643  imelysin  42.34 
 
 
417 aa  287  4e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0272375  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4366  iron-regulated protein A, putative  41.95 
 
 
452 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2557  putative iron-regulated protein  40.94 
 
 
431 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000340096  hitchhiker  0.000000144413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4578  hypothetical protein  40 
 
 
424 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.219407 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4315  hypothetical protein  39.9 
 
 
424 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0335  hypothetical protein  38.57 
 
 
425 aa  261  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0199  putative iron-regulated protein  39.56 
 
 
441 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.929699 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1368  putative lipoprotein  42.38 
 
 
420 aa  256  8e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1548  imelysin  39.56 
 
 
422 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3529  putative iron-regulated protein  41.71 
 
 
426 aa  251  3e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2199  imelysin  40.7 
 
 
422 aa  250  4e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3028  hypothetical protein  38.61 
 
 
422 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.395482  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0563  iron-regulated protein  44.65 
 
 
420 aa  243  7e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0688  uncharacterized iron-regulated protein  41.44 
 
 
429 aa  242  9e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1525  putative iron-regulated protein  35.27 
 
 
428 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0217885 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3197  putative iron-regulated protein  36.55 
 
 
428 aa  230  3e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.767807  normal  0.856839 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3868  Peptidase M75, Imelysin  37.17 
 
 
441 aa  230  6e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.670817  normal  0.169885 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1458  iron-regulated protein A, putative  34.24 
 
 
399 aa  204  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.449627  normal  0.841376 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2561  putative iron-regulated protein  37.07 
 
 
400 aa  198  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000126038 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1925  putative iron-regulated protein  34.98 
 
 
407 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00330682 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0666  imelysin  32.6 
 
 
410 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.511316  normal  0.787611 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0676  putative lipoprotein  25 
 
 
382 aa  54.3  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0244175 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1462  imelysin  31 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0336824  normal  0.0166245 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3792  putative lipoprotein  38.55 
 
 
384 aa  47.4  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0722  putative lipoprotein  22.19 
 
 
387 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00126841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>