14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1623 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1623  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  642    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0082001 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2353  hypothetical protein  47.57 
 
 
296 aa  278  7e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00225651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0860  hypothetical protein  45.09 
 
 
229 aa  200  3e-50  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.182154  normal  0.631757 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1160  hypothetical protein  34.76 
 
 
314 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0763364  normal  0.412717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2473  hypothetical protein  32.46 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.500779  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1641  hypothetical protein  29.78 
 
 
388 aa  68.9  0.00000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3695  hypothetical protein  30.13 
 
 
361 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0185  hypothetical protein  32.06 
 
 
402 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543863  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3139  hypothetical protein  29.66 
 
 
195 aa  50.4  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3666  hypothetical protein  23.19 
 
 
413 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145124  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1305  hypothetical protein  25.29 
 
 
175 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.582103 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2274  hypothetical protein  24.86 
 
 
187 aa  44.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000533455  normal  0.189783 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4691  hypothetical protein  25.31 
 
 
188 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0679  hypothetical protein  37.68 
 
 
214 aa  44.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>