17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_1368 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007969  Pcryo_1368  phage integrase  100 
 
 		 526 aa  1090    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.509686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5179  integrase family protein  24.01 
 
 		 505 aa  97.1  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.285991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4986  Phage integrase  25.82 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01692  hypothetical protein  23.9 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1846  hypothetical protein  23.9 
 
 		 522 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0660802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2309  phage integrase family protein  22.97 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0558  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0589  integrase family protein  23.53 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0583  integrase family protein  23.53 
 
 		 517 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2290  integrase family protein  24.68 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0329  Phage integrase  22.54 
 
 		 513 aa  48.5  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.793111  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  24.49 
 
 		 300 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  25.74 
 
 		 307 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1017  phage integrase family protein  44.44 
 
 		 418 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0440345  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  23.63 
 
 		 313 aa  43.5  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4455  integrase family protein  23.91 
 
 		 339 aa  43.5  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000000349863  hitchhiker  0.00111504 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4604  site-specific recombinase, phage integrase family  22.6 
 
 		 531 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.049698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>