131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2681 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  100 
 
 		 166 aa  317  5e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  32.72 
 
 		 178 aa  94  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  35.1 
 
 		 169 aa  90.5  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3791  Colicin V production protein  32.45 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3696  Colicin V production protein  32.45 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  32.45 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  32.19 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  31.97 
 
 		 177 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  31.13 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  33.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  29.07 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1044  Colicin V production protein  27.98 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.572812 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  31.47 
 
 		 159 aa  62  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  29.65 
 
 		 163 aa  61.6  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  32.87 
 
 		 164 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  29.33 
 
 		 168 aa  58.9  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3051  colicin V production protein  29.8 
 
 		 163 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00964388  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  29.86 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  31.41 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  28.4 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.52 
 
 		 166 aa  56.6  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0777  colicin V production protein  27.89 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136777  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  25.62 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  30.77 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  27.33 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  29.17 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  26.06 
 
 		 190 aa  54.3  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  30.41 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  30.58 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2162  colicin V production protein  29.41 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.340208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  29.5 
 
 		 170 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  30.15 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  31.03 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  30.43 
 
 		 189 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  39.31 
 
 		 186 aa  52.4  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  26.9 
 
 		 192 aa  52.4  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  51.6  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  25.95 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  30.15 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  28.74 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  31.88 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  31.88 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  31.88 
 
 		 164 aa  51.6  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  29.41 
 
 		 162 aa  51.2  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  32.37 
 
 		 170 aa  51.2  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  28.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  28.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  28.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  28.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  28.67 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1672  colicin V production protein  32.14 
 
 		 163 aa  50.8  0.000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  31.16 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  29.05 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  29.86 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  28.67 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6836  Colicin V production protein  33.57 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612916 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  30.43 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4988  Colicin V production protein  27.07 
 
 		 181 aa  48.9  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0206399  normal  0.011755 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  29.33 
 
 		 190 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02100  hypothetical protein  27.69 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  30.43 
 
 		 164 aa  48.9  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30.43 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  28.45 
 
 		 203 aa  48.1  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4380  colicin V production protein  29.71 
 
 		 164 aa  47.8  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.452488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  27.97 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2438  colicin V production protein  29.37 
 
 		 162 aa  47.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47.4  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4770  colicin V production protein  27.4 
 
 		 163 aa  47.4  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3065  colicin V production protein  29.37 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1489  colicin V production protein  29.66 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000231949  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1470  colicin V production protein  27.78 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  26.35 
 
 		 189 aa  46.6  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2147  colicin V production protein  28.19 
 
 		 162 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.936952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  29.33 
 
 		 187 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  30.99 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  27.27 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  30 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.08 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  29.08 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  26.62 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  28.37 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  27.34 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  27.34 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  29.86 
 
 		 162 aa  46.2  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  31.68 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2739  colicin V production protein  28.77 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>