More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2219 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2219  50S ribosomal protein L19  100 
 
 		 115 aa  233  8e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.43443e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0648  50S ribosomal protein L19  74.34 
 
 		 118 aa  176  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2866  50S ribosomal protein L19  74.34 
 
 		 118 aa  174  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000321036  hitchhiker  0.000000487764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2455  50S ribosomal protein L19  69.57 
 
 		 119 aa  169  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0707667  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3758  50S ribosomal protein L19  71.68 
 
 		 118 aa  168  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000121347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3426  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.205181  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3488  50S ribosomal protein L19  69.03 
 
 		 118 aa  164  4e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5511499999999998e-20 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1201  50S ribosomal protein L19  66.07 
 
 		 115 aa  161  3e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000297862  normal  0.163388 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1093  50S ribosomal protein L19  66.09 
 
 		 119 aa  160  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00704919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0661  50S ribosomal protein L19  64.04 
 
 		 115 aa  158  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00126623  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5922  ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0433266  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2473  ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 114 aa  153  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2852  ribosomal protein L19  65.18 
 
 		 114 aa  153  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151423  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0607  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 119 aa  152  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.00000101225  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1149  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 128 aa  152  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000797714  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0989  ribosomal protein L19  62.83 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000000485147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3002  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00296936  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3044  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00272781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2883  50S ribosomal protein L19  63.39 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.533636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0971  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 113 aa  151  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3755  50S ribosomal protein L19  65.49 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000580352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2663  50S ribosomal protein L19  62.71 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2090  ribosomal protein L19  63.72 
 
 		 113 aa  150  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.218135  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2185  50S ribosomal protein L19  61.95 
 
 		 114 aa  150  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0675384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09790  LSU ribosomal protein L19P  61.95 
 
 		 119 aa  150  7e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.54883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0945  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 114 aa  150  7e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000423852  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0807  50S ribosomal protein L19  63.96 
 
 		 116 aa  149  8.999999999999999e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.000000000000011018  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10020  LSU ribosomal protein L19P  60.53 
 
 		 116 aa  148  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.155501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1095  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 115 aa  148  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2536  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 118 aa  148  2e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.284207 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2719  50S ribosomal protein L19  62.93 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.877086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2219  50S ribosomal protein L19  59.13 
 
 		 119 aa  147  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000293705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1630  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 113 aa  147  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11090  LSU ribosomal protein L19P  57.89 
 
 		 120 aa  147  3e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.168446  normal  0.0967881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1188  50S ribosomal protein L19  60.34 
 
 		 163 aa  148  3e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.186255  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3590  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  147  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1557  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 121 aa  148  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.940156  normal  0.0562207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4003  ribosomal protein L19  58.77 
 
 		 118 aa  148  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2146  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2050  50S ribosomal protein L19  60.36 
 
 		 115 aa  147  4e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000005578  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1300  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000348159  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1325  50S ribosomal protein L19  62.16 
 
 		 116 aa  147  4e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150512  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2492  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000053876  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0544  50S ribosomal protein L19  61.4 
 
 		 115 aa  147  6e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000438423  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3132  ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 116 aa  147  6e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000124659  normal  0.100655 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0666  50S ribosomal protein L19  63.64 
 
 		 114 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1144  50S ribosomal protein L19  60.53 
 
 		 115 aa  147  7e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000366814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2304  ribosomal protein L19  61.74 
 
 		 117 aa  146  8e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000000980437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1152  50S ribosomal protein L19  60.18 
 
 		 118 aa  146  8e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0252856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1986  ribosomal protein L19  60.91 
 
 		 118 aa  145  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2479  50S ribosomal protein L19  58.26 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0120015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3419  ribosomal protein L19  62.5 
 
 		 116 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.30141  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1093  ribosomal protein L19  60 
 
 		 116 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000484447  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1402  ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 117 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00379521 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1790  50S ribosomal protein L19  59.82 
 
 		 115 aa  144  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1950  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.648342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1970  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.101301  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2899  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 132 aa  145  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2016  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  144  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.854674 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0972  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000207565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1198  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 118 aa  144  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.633617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1366  ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 114 aa  144  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1309  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 118 aa  143  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3882  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000143455  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3887  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000863076  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3691  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000105797  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3581  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.43871e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3599  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000284782  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3978  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000147607  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3853  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.655990000000001e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3938  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000138289  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1305  50S ribosomal protein L19  61.61 
 
 		 114 aa  143  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000891936  unclonable  6.6564e-26 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4170  50S ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 113 aa  143  8.000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0228  ribosomal protein L19  60 
 
 		 119 aa  143  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12918  50S ribosomal protein L19  61.06 
 
 		 113 aa  142  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.766698 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23710  LSU ribosomal protein L19P  57.39 
 
 		 118 aa  143  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461467  normal  0.196781 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3309  ribosomal protein L19  56.52 
 
 		 115 aa  142  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1422  ribosomal protein L19  60.17 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.420592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1360  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1171  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251517  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1213  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000888328  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3663  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 114 aa  142  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000597471  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1290  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000003977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2107  50S ribosomal protein L19  60.68 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00250382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1257  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000504967  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1171  ribosomal protein L19  59.29 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2835  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000148121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2917  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000128835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3100  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000026861  normal  0.106468 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0507  50S ribosomal protein L19  62.07 
 
 		 116 aa  141  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3014  50S ribosomal protein L19  64.86 
 
 		 117 aa  142  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000550721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2192  50S ribosomal protein L19  58.41 
 
 		 113 aa  142  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0700622  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0098  50S ribosomal protein L19  63.06 
 
 		 117 aa  141  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154416  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0983  50S ribosomal protein L19  60.71 
 
 		 120 aa  140  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.337107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0789  50S ribosomal protein L19  59.46 
 
 		 127 aa  140  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  9.23665e-16  unclonable  1.39809e-28 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02495  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0233029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1068  ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000854887  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3845  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0054034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2995  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2890  50S ribosomal protein L19  61.26 
 
 		 115 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00198618  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>