More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2216 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2216  NAD synthetase  100 
 
 
652 aa  1350    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808702  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1200  NAD synthetase  54.69 
 
 
642 aa  734    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0182  NAD+ synthetase  51.7 
 
 
676 aa  654    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3426  NAD+ synthetase  53.01 
 
 
647 aa  686    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1314  NAD synthetase  52.15 
 
 
635 aa  681    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1130  NAD synthetase  51.83 
 
 
635 aa  679    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0325  NAD synthetase  53.88 
 
 
645 aa  712    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0404544  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0531  NAD synthetase  47.6 
 
 
647 aa  614  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0620  NAD+ synthetase  50.55 
 
 
644 aa  605  1.0000000000000001e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.232331  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2533  NAD synthetase  45.9 
 
 
691 aa  570  1e-161  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2610  NAD synthetase  47.48 
 
 
682 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2679  NAD synthetase  45.78 
 
 
686 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5214  NAD+ synthetase  45.67 
 
 
680 aa  562  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0536681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2204  NAD synthetase  45.88 
 
 
692 aa  565  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0453723  normal  0.881972 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2164  NAD synthetase  46.41 
 
 
689 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2890  NAD synthetase  46.86 
 
 
679 aa  561  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2044  NAD synthetase  44.93 
 
 
681 aa  552  1e-156  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3909  NAD synthase  46.51 
 
 
678 aa  555  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2595  NAD synthetase  46.38 
 
 
687 aa  551  1e-155  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.649167  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2095  NAD synthetase  44.41 
 
 
714 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4906  NAD synthetase  46.5 
 
 
679 aa  545  1e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0664942  hitchhiker  0.00795147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0483  NAD+ synthetase  45.97 
 
 
679 aa  544  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0680  NAD synthetase  46.24 
 
 
716 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.576503 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3633  NAD+ synthetase  44.44 
 
 
704 aa  544  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400497  hitchhiker  0.00213692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4405  NAD synthetase  45.88 
 
 
690 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.863566  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3548  NAD synthetase  44.25 
 
 
680 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2642  NAD synthetase  44.69 
 
 
680 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.309043  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3543  NAD synthetase  44.25 
 
 
680 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3616  NAD synthetase  44.25 
 
 
680 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.4812  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3940  NAD synthetase  44.48 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.381812  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4035  NAD synthetase  45.58 
 
 
690 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0650104 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1782  NAD+ synthetase  45.39 
 
 
686 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0217619 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2169  NAD synthetase  44.78 
 
 
685 aa  532  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0634324  hitchhiker  0.00000227772 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4914  NAD synthetase  46.26 
 
 
683 aa  531  1e-149  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4517  NAD synthetase  44.93 
 
 
690 aa  530  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.516148 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4206  NAD synthetase  45.81 
 
 
681 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12465  NAD synthetase  44.39 
 
 
738 aa  523  1e-147  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000230879  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0979  NAD synthetase  44.26 
 
 
678 aa  520  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.989674  normal  0.179553 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0919  NAD synthetase  46.26 
 
 
802 aa  519  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3271  NAD(+) synthase (glutamine-hydrolyzing)  44.05 
 
 
682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3750  NAD synthetase  44.44 
 
 
699 aa  512  1e-144  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0534527 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1103  NAD synthetase  43.54 
 
 
684 aa  508  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.635077 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1400  NAD synthetase  39.54 
 
 
650 aa  416  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0507  NAD+ synthetase  34.75 
 
 
600 aa  374  1e-102  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28360  NAD synthase  48.4 
 
 
846 aa  330  6e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.455485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3480  NAD+ synthetase  30.91 
 
 
587 aa  197  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0342868  normal  0.0247199 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1558  NAD+ synthetase  26.86 
 
 
573 aa  189  1e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0286387  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0918  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.94 
 
 
591 aa  189  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.262249  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1404  NAD synthetase  27.4 
 
 
574 aa  184  3e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0189594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1045  NAD+ synthetase  29.14 
 
 
658 aa  182  1e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.700176  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0767  NAD+ synthetase  27.54 
 
 
583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.296939  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0876  NAD+ synthetase  31.15 
 
 
554 aa  181  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6745  NAD+ synthetase  26.49 
 
 
688 aa  180  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.960806 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2763  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  29.24 
 
 
577 aa  178  4e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2417  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  25.99 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.906393  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3593  NAD+ synthetase  29.3 
 
 
577 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1518  NAD synthetase  27.35 
 
 
576 aa  170  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0640  NAD+ synthetase  24.85 
 
 
700 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0635505 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1567  NAD synthetase  27.02 
 
 
576 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1869  NAD+ synthetase  26.52 
 
 
575 aa  168  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0461361  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1882  NAD+ synthetase  29.29 
 
 
552 aa  168  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2832  NAD+ synthetase  25.64 
 
 
686 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0268  NAD synthetase  27.2 
 
 
561 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0268  NAD synthetase  27.09 
 
 
561 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3297  NAD+ synthetase  30.03 
 
 
599 aa  166  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3089  NAD synthetase  25.74 
 
 
561 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.447484  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2553  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  30.25 
 
 
540 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0396005 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3401  NAD+ synthetase  26.8 
 
 
611 aa  164  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3032  NAD synthetase  25.59 
 
 
561 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0270  putative NH3-dependent (glutamine-hydrolyzing) NAD(+) synthetase  28.07 
 
 
567 aa  162  2e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0311  NAD+ synthetase  27.48 
 
 
567 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0296  NAD+ synthetase  27.11 
 
 
567 aa  161  3e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.50614  normal  0.755509 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0553  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.95 
 
 
577 aa  161  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.795829  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1372  NAD+ synthetase  26.42 
 
 
545 aa  160  6e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1122  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.2 
 
 
566 aa  160  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.049761  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2961  NAD+ synthetase  27.55 
 
 
545 aa  160  7e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0904337 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1984  NAD synthetase  24.96 
 
 
584 aa  160  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187378  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0969  NAD(+) synthetase  28.7 
 
 
539 aa  159  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11920  glutamine-dependent NAD+ synthase  27.9 
 
 
556 aa  159  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0417  NAD synthetase  25.69 
 
 
566 aa  159  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.974378  normal  0.0364261 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0922  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  27.46 
 
 
542 aa  157  4e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.906814  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1290  NAD synthetase  26.9 
 
 
538 aa  158  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.279167 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_940  glutamine-dependent NAD(+) synthetase  28.11 
 
 
566 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0951  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  28.23 
 
 
566 aa  157  4e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3340  NAD+ synthetase  28.81 
 
 
598 aa  158  4e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.316593  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1409  NAD synthetase  25.63 
 
 
561 aa  157  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0887  NAD synthetase  28.37 
 
 
545 aa  157  7e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0727  NAD+ synthetase  27.53 
 
 
567 aa  157  7e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.47874  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0290  NAD synthetase  26.04 
 
 
560 aa  156  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.950907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1011  NAD synthetase  28.19 
 
 
545 aa  155  2e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0196449  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04876  NAD synthetase  26.97 
 
 
547 aa  154  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.661623  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3162  NAD synthetase  27.37 
 
 
544 aa  154  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1093  NAD+ synthetase  27.64 
 
 
542 aa  154  4e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.588996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1524  NAD+ synthetase  28.55 
 
 
559 aa  154  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.14105 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1761  NAD+ synthetase  29.01 
 
 
554 aa  153  8.999999999999999e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15260  NAD+ synthetase  27.2 
 
 
553 aa  153  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.874771  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1961  NAD+ synthetase  28.83 
 
 
554 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07390  NAD+ synthetase  27.2 
 
 
577 aa  152  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2296  NAD+ synthetase  24.42 
 
 
543 aa  151  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2524  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  27.9 
 
 
556 aa  150  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.421348 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>