14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2187 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2187  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1021    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.080107  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3403  hypothetical protein  38.09 
 
 		 460 aa  299  8e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717001  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0110  hypothetical protein  34.38 
 
 		 454 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3254  LamB porin family protein, putative  35.34 
 
 		 472 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000126624  decreased coverage  1.37943e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0656  hypothetical protein  33.2 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000988469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3304  LamB porin family protein, putative  33.86 
 
 		 457 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00991387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2284  hypothetical protein  31.79 
 
 		 447 aa  199  9e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000344842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1933  hypothetical protein  32.85 
 
 		 434 aa  190  5e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000351856  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0521  LamB porin family protein, putative  31.74 
 
 		 464 aa  182  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000174972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1309  hypothetical protein  35.01 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0570  hypothetical protein  29.34 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.74433e-18 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0557  hypothetical protein  30.64 
 
 		 452 aa  174  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000338101  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3257  LamB porin family protein, putative  29.11 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000051646  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1745  hypothetical protein  25.71 
 
 		 534 aa  51.2  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000216111  unclonable  0.0000185199 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>