23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1622 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  259  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  72.22 
 
 		 134 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  73.02 
 
 		 134 aa  197  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  69.53 
 
 		 132 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  68.5 
 
 		 135 aa  194  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  69.6 
 
 		 139 aa  189  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  66.67 
 
 		 184 aa  187  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  67.72 
 
 		 135 aa  187  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  68.8 
 
 		 139 aa  187  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  66.67 
 
 		 144 aa  186  1e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  67.2 
 
 		 139 aa  184  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  67.2 
 
 		 139 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  66.67 
 
 		 134 aa  184  5e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  67.74 
 
 		 135 aa  182  9e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  71.88 
 
 		 133 aa  167  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  72 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  41.79 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  49.12 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  47.17 
 
 		 154 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  40.85 
 
 		 164 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  51.43 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0744  TM2  46 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>