More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2530 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2530  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  755    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03656  hypothetical protein  46.22 
 
 		 331 aa  306  3e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3579  hypothetical protein  38.32 
 
 		 333 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.50188 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3342  glycosyl transferase, putative  37.61 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.534413  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3172  hypothetical protein  37.43 
 
 		 333 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.102896  normal  0.287439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28160  hypothetical protein  39.3 
 
 		 328 aa  215  9e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30360  hypothetical protein  36.39 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3602  hypothetical protein  35.44 
 
 		 333 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3401  hypothetical protein  36.77 
 
 		 334 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.51245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2381  hypothetical protein  36.8 
 
 		 331 aa  206  7e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.148789  normal  0.0161209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2599  hypothetical protein  36.09 
 
 		 327 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.733501  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3997  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.937914  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1836  hypothetical protein  36.25 
 
 		 333 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000267985 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2812  glycosyl transferase family protein  35.87 
 
 		 337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1665  hypothetical protein  35.28 
 
 		 332 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1161  hypothetical protein  30.84 
 
 		 327 aa  172  5.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.18822  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001604  glycosyl transferase family 3  38.19 
 
 		 317 aa  168  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05584  hypothetical protein  33.95 
 
 		 317 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1809  glycosyl transferase family protein  28.9 
 
 		 408 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0848  hypothetical protein  33.07 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1507  glycosyl transferase family protein  31.2 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3046  hypothetical protein  31.48 
 
 		 319 aa  142  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0326711  normal  0.877697 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1670  hypothetical protein  31.67 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0478591  normal  0.302071 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1873  glycosyl transferase family protein  29.9 
 
 		 376 aa  138  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.597248  hitchhiker  0.00000310641 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2767  glycosyl transferase family protein  29.64 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.0391357 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2358  Anthranilate phosphoribosyltransferase  36.41 
 
 		 346 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4280  hypothetical protein  27.16 
 
 		 506 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3531  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.447147  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2882  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 322 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1580  glycosyl transferase family protein  25.3 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1762  Anthranilate phosphoribosyltransferase  29.44 
 
 		 350 aa  83.6  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4332  hypothetical protein  30.56 
 
 		 350 aa  82.8  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3280  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 		 301 aa  82.4  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1467  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3794  hypothetical protein  24.02 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.516461  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2494  glycosyl transferase family protein  26.53 
 
 		 322 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0088  glycosyl transferase family 3  28.21 
 
 		 368 aa  78.2  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.826373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2842  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2320  glycosyl transferase family protein  28.95 
 
 		 318 aa  78.2  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.101648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1594  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1487  glycosyl transferase family protein  24.42 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0867  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0949  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00767  hypothetical protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2842  Glycosyl transferase, family 3-like protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2843  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.037407 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00784  hypothetical protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0855  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2331  glycosyl transferase family protein  26.83 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0852797  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0824  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.993844 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1780  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 		 319 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.301488 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1980  glycosyl transferase family protein  27.32 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.230726  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2882  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2104  glycosyl transferase family protein  23.36 
 
 		 308 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0754859  normal  0.466514 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0885  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0917  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0949  glycosyl transferase family protein  23.87 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2471  hypothetical protein  27.85 
 
 		 351 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0858  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2369  glycosyl transferase family protein  26.32 
 
 		 316 aa  75.5  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0970  glycosyl transferase family protein  23.46 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1003  glycosyl transferase family protein  26.26 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3637  hypothetical protein  28.72 
 
 		 351 aa  73.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2397  glycosyl transferase family protein  24.9 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1290  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.127601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2552  glycosyl transferase family protein  24.28 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1403  glycosyl transferase family protein  28.72 
 
 		 301 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.508618 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3296  glycosyl transferase family protein  27.82 
 
 		 304 aa  71.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0655575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1483  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 341 aa  70.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1273  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.92 
 
 		 341 aa  70.5  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2293  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.129801  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1586  Anthranilate phosphoribosyltransferase  26.53 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0253  glycosyl transferase family protein  28.12 
 
 		 336 aa  70.1  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21741  hypothetical protein  25.57 
 
 		 352 aa  70.1  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.349556  normal  0.259448 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4534  hypothetical protein  28.72 
 
 		 359 aa  69.3  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0815  glycosyl transferase family protein  26.7 
 
 		 329 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0303571  hitchhiker  0.00126727 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1591  anthranilate phosphoribosyltransferase  24.26 
 
 		 530 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0795732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0234  glycosyl transferase family protein  29.38 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1301  hypothetical protein  25.19 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0504  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.79 
 
 		 349 aa  68.6  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2467  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.86 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0530103  normal  0.417662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2690  glycosyl transferase family protein  28.71 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.335373 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0160  anthranilate phosphoribosyltransferase  27.47 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1444  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.41 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1253  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.51 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0270  anthranilate phosphoribosyltransferase-like protein  28.28 
 
 		 371 aa  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2892  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.58 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4054  anthranilate phosphoribosyltransferase  26.63 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0513  Anthranilate phosphoribosyltransferase  24.68 
 
 		 355 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0477  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.72 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18281  hypothetical protein  24.7 
 
 		 352 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1680  hypothetical protein  28.27 
 
 		 357 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.99598 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5575  anthranilate phosphoribosyltransferase  31.02 
 
 		 337 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1598  hypothetical protein  25.65 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.267194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1046  anthranilate phosphoribosyltransferase  29.47 
 
 		 349 aa  64.3  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2176  Glycosyl transferase, family 3-like protein  24.81 
 
 		 373 aa  63.5  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.261801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4482  anthranilate phosphoribosyltransferase  28.36 
 
 		 337 aa  63.2  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0336855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4702  Glycosyl transferase, family 3-like protein  28.02 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2289  hypothetical protein  24.45 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0274  glycosyl transferase family protein  22.38 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.226663 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>