32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1308 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1308  hypothetical protein  100 
 
 		 258 aa  530  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01189  lipoprotein, putative  51.27 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.44908  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1469  putative lipoprotein  48.3 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1799  putative lipoprotein  39.39 
 
 		 222 aa  113  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004180  hypothetical protein  39.39 
 
 		 212 aa  112  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01277  hypothetical protein  37.88 
 
 		 212 aa  110  3e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2345  hypothetical protein  36.36 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01190  hypothetical protein  27.35 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1300  hypothetical protein  27.07 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.230835  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2969  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1409  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3107  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.841138 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2604  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.791394  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3257  hypothetical protein  29.01 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2954  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1333  hypothetical protein  34.26 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1322  hypothetical protein  28.24 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1314  hypothetical protein  27.48 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.325091 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3094  hypothetical protein  28.12 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1590  hypothetical protein  30.5 
 
 		 208 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1252  hypothetical protein  27.48 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1296  hypothetical protein  28.29 
 
 		 237 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1338  hypothetical protein  30.51 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1309  hypothetical protein  28.48 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1022  hypothetical protein  25.14 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000840658  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2325  hypothetical protein  26.81 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.927905  normal  0.207292 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1152  hypothetical protein  24.64 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01188  hypothetical protein  26.55 
 
 		 221 aa  52.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2511  hypothetical protein  25.4 
 
 		 188 aa  52  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1729  putative lipoprotein  26.05 
 
 		 276 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1608  hypothetical protein  25.2 
 
 		 205 aa  46.6  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387394 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0115  hypothetical protein  27.73 
 
 		 313 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.167532 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>