41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0344 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0344  YHS domain-containing protein  100 
 
 		 159 aa  330  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1502  YHS domain-containing protein  54.41 
 
 		 147 aa  155  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000768373 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0591  hypothetical protein  50.75 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0413  hypothetical protein  50.74 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.940702  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3004  YHS domain-containing protein  46.48 
 
 		 152 aa  124  5e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.392798  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3420  hypothetical protein  43.45 
 
 		 168 aa  121  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0574183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2511  YHS domain protein  46.38 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0278163 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2489  hypothetical protein  46.96 
 
 		 174 aa  110  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1871  hypothetical protein  40.54 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3054  YHS domain-containing protein  47.32 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.190417  hitchhiker  0.00884153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3840  hypothetical protein  43.38 
 
 		 163 aa  107  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000166878  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3397  hypothetical protein  42.75 
 
 		 161 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.492044  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0814  hypothetical protein  40 
 
 		 159 aa  103  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0295  YHS domain-containing protein  39.5 
 
 		 150 aa  98.6  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2573  hypothetical protein  42.02 
 
 		 151 aa  98.6  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.243278  hitchhiker  0.000000387567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2766  hypothetical protein  41.82 
 
 		 150 aa  94.7  4e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.395057  hitchhiker  0.00432931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1024  hypothetical protein  35.25 
 
 		 181 aa  94.4  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.476818  normal  0.586442 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2513  hypothetical protein  41.88 
 
 		 158 aa  94  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0288069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1901  YHS  37.88 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0342245  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3074  hypothetical protein  40.37 
 
 		 161 aa  85.5  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.479562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2051  hypothetical protein  28.76 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1237  hypothetical protein  36.7 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1237  hypothetical protein  36.7 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01845  hypothetical protein  44.21 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.207418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1716  hypothetical protein  44.58 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000302746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2517  YHS domain protein  35.54 
 
 		 181 aa  73.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.483229  normal  0.0264071 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3825  hypothetical protein  31.58 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.972856 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2799  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  36.61 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1688  hypothetical protein  36.73 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0271736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1729  YHS  26.75 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4039  hypothetical protein  33.33 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.285921  normal  0.0353686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4250  hypothetical protein  32.74 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.531589  normal  0.449683 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1814  hypothetical protein  32.11 
 
 		 168 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3681  hypothetical protein  30.28 
 
 		 168 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.137304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6562  hypothetical protein  30.09 
 
 		 176 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0661  hypothetical protein  29.41 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.313662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4842  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.203705  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0517  hypothetical protein  23.85 
 
 		 168 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3923  hypothetical protein  31.19 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000190971  normal  0.484553 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0281  YHS domain protein  34.68 
 
 		 163 aa  52.8  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3379  hypothetical protein  29.2 
 
 		 190 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>