29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2294 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_2294  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0248697 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  73.38 
 
 
278 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  73.45 
 
 
275 aa  430  1e-119  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  69.78 
 
 
278 aa  422  1e-117  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0955  methyltransferase-like protein  53.54 
 
 
249 aa  206  4e-52  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0511  methyltransferase type 11  44.44 
 
 
297 aa  145  6e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0443  Spermine synthase  41.62 
 
 
293 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2036  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  101  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1957  hypothetical protein  33.21 
 
 
282 aa  100  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37177  predicted protein  33.51 
 
 
239 aa  97.8  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0215141  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04179  hypothetical protein  32.57 
 
 
281 aa  95.5  9e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.697119  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0392  hypothetical protein  33.97 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  27.16 
 
 
286 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  26.53 
 
 
287 aa  45.8  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2552  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.43 
 
 
706 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  24.15 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0923  O-methyltransferase family 3  25 
 
 
209 aa  44.3  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3503  methyltransferase  26.12 
 
 
220 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000923183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4034  methyltransferase  38.82 
 
 
184 aa  44.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1623  putative methylase  24.42 
 
 
202 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1987  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.43 
 
 
706 aa  43.5  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2641  23S rRNA m(2)G2445 methyltransferase  31.43 
 
 
706 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  29.56 
 
 
279 aa  43.5  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  27.82 
 
 
286 aa  43.1  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1947  hypothetical protein  28.91 
 
 
206 aa  43.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1348  methyltransferase  25.58 
 
 
186 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.329844  normal  0.198697 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  24.61 
 
 
285 aa  42.7  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0346  PUA domain containing protein  26.23 
 
 
400 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.734176 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  30.77 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.725574 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>