27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0215 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0215  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  486  1e-136  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.260844  normal  0.647762 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1323  hypothetical protein  67.51 
 
 
239 aa  333  2e-90  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.551661  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0224  hypothetical protein  68.64 
 
 
239 aa  328  5.0000000000000004e-89  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.418253  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0737  hypothetical protein  49.37 
 
 
238 aa  222  4e-57  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000184342 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1418  hypothetical protein  41.7 
 
 
245 aa  176  3e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0657187 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0146  protein of unknown function DUF178  22.4 
 
 
245 aa  62.4  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00604091  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2017  hypothetical protein  27.91 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2652  protein of unknown function DUF178  26.06 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000132342 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
625 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1564  protein of unknown function DUF178  27.57 
 
 
273 aa  52.8  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000640469  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0986  hypothetical protein  26.77 
 
 
278 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167852  decreased coverage  0.00614129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1828  hypothetical protein  23.27 
 
 
273 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000107819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1524  protein of unknown function DUF178  25.88 
 
 
271 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.410442  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3342  hypothetical protein  26.18 
 
 
278 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1158  hypothetical protein  21.48 
 
 
275 aa  49.3  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.640507  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2194  hypothetical protein  23.5 
 
 
284 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1845  hypothetical protein  31.37 
 
 
286 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1601  protein of unknown function DUF178  26.09 
 
 
275 aa  46.6  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.506959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2162  hypothetical protein  24.46 
 
 
271 aa  45.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2125  hypothetical protein  27.03 
 
 
275 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0524  hypothetical protein  20.95 
 
 
253 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0796  hypothetical protein  23.81 
 
 
291 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0141719  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  26.75 
 
 
626 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0522  hypothetical protein  26.84 
 
 
292 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.783802 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0549  hypothetical protein  28.99 
 
 
294 aa  42  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3086  hypothetical protein  28.35 
 
 
286 aa  42  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000103866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  25.93 
 
 
626 aa  41.6  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>