32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0153 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0153  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  353  7.999999999999999e-97  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0141  hypothetical protein  69.89 
 
 
176 aa  256  1e-67  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0775358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0123  hypothetical protein  70.45 
 
 
176 aa  247  5e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1191  hypothetical protein  63.64 
 
 
176 aa  229  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2219  conserved hypothetical protein  47.67 
 
 
183 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.160192  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0613  hypothetical protein  42.86 
 
 
174 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0853  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  47.34 
 
 
172 aa  144  6e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.313328  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1369  hypothetical protein  48.17 
 
 
181 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1753  hypothetical protein  38.66 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1696  hypothetical protein  37.13 
 
 
171 aa  74.7  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.786228  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0593  hypothetical protein  31.33 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0462  hypothetical protein  29.45 
 
 
166 aa  67  0.0000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0934  hypothetical protein  30.25 
 
 
184 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0918  hypothetical protein  29.49 
 
 
181 aa  61.2  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2925  hypothetical protein  35.62 
 
 
182 aa  48.5  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.221472  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65010  hypothetical protein  33.61 
 
 
195 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2694  hypothetical protein  32.5 
 
 
184 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4122  hypothetical protein  27.74 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0886101  hitchhiker  0.000000544297 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0404  hypothetical protein  35.16 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1351  hypothetical protein  32.5 
 
 
184 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  0.0642943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5649  hypothetical protein  32.54 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0660  hypothetical protein  29.3 
 
 
195 aa  42  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.669622  hitchhiker  0.000933875 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4927  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  42  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000326766 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2975  hypothetical protein  33.94 
 
 
186 aa  42.4  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000170346  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_587  hypothetical protein  36.71 
 
 
196 aa  41.6  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000756332  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4749  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  42  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000783425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4871  hypothetical protein  33.33 
 
 
195 aa  42  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.404422  normal  0.0821224 
 
 
-
 
NC_002936  DET0682  hypothetical protein  35.37 
 
 
138 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.304862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0648  hypothetical protein  35.37 
 
 
138 aa  42  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0149503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2369  hypothetical protein  34.23 
 
 
196 aa  41.6  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.602819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2087  hypothetical protein  31.47 
 
 
194 aa  40.8  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0619  hypothetical protein  36.71 
 
 
209 aa  40.8  0.01  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000505502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>