24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2357 on replicon NC_011061
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011061  Paes_2357  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  661    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4567  TOPRIM domain protein  40.73 
 
 
918 aa  255  6e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4644  TOPRIM domain protein  40.13 
 
 
517 aa  251  8.000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4601  TOPRIM domain protein  40.13 
 
 
517 aa  248  7e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008764  Pnap_5006  relaxase/mobilization nuclease family protein  41.37 
 
 
828 aa  208  8e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6836  hypothetical protein  28.19 
 
 
632 aa  97.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000213305  normal  0.0288754 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6695  hypothetical protein  26.19 
 
 
455 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.681272  normal  0.16594 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0143  hypothetical protein  26.05 
 
 
608 aa  80.9  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0192174  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6182  hypothetical protein  28.85 
 
 
296 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0783735 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3748  hypothetical protein  29.65 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008770  CJJ81176_pVir0032  hypothetical protein  23.47 
 
 
417 aa  68.9  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000480252  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4970  hypothetical protein  23.99 
 
 
325 aa  65.9  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440005  normal  0.817336 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4470  hypothetical protein  25.16 
 
 
308 aa  62.8  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.445882  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4734  hypothetical protein  26.02 
 
 
343 aa  62.4  0.000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.861915  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4890  hypothetical protein  25.65 
 
 
319 aa  61.6  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.898928 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0262  hypothetical protein  24.92 
 
 
344 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4653  hypothetical protein  24.84 
 
 
322 aa  57.4  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.722495  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1109  hypothetical protein  31.29 
 
 
755 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.941009  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1636  hypothetical protein  31.13 
 
 
196 aa  55.5  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.42824  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1276  hypothetical protein  24.4 
 
 
358 aa  49.3  0.00008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9158  hypothetical protein  24.92 
 
 
320 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0434  plasmid recombination protein  23.95 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4311  hypothetical protein  22.15 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.721835  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0074  hypothetical protein  26.09 
 
 
341 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>