32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0822 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0822  preprotein translocase subunit SecG  100 
 
 
118 aa  228  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264416  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0720  preprotein translocase subunit SecG  64.22 
 
 
114 aa  141  3e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1628  preprotein translocase subunit SecG  65.81 
 
 
117 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.732885  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1629  preprotein translocase subunit SecG  62.86 
 
 
119 aa  133  8e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000355121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2085  preprotein translocase subunit SecG  61.9 
 
 
120 aa  123  7e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000374558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1531  preprotein translocase subunit SecG  62.26 
 
 
117 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0931  preprotein translocase subunit SecG  58.97 
 
 
115 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.966057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0315  preprotein translocase, SecG subunit  37.5 
 
 
125 aa  50.8  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0201643  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0569  preprotein translocase subunit SecG  30.63 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.403182  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1825  preprotein translocase subunit SecG  33.98 
 
 
111 aa  45.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.713592  normal  0.042433 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0805  preprotein translocase subunit SecG  31.53 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.367958  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3468  preprotein translocase, SecG subunit  32.14 
 
 
111 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2063  preprotein translocase subunit SecG  27.97 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0595  preprotein translocase subunit SecG  28.7 
 
 
110 aa  44.3  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.680652  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0486  preprotein translocase subunit SecG  30.36 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.065883  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1845  preprotein translocase, SecG subunit  50.88 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2731  preprotein translocase, SecG subunit  35.8 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2349  protein translocase subunit secG  45.76 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3283  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000869835  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1237  preprotein translocase, SecG subunit  38.3 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3420  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000118136  decreased coverage  0.0000944454 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0169  preprotein translocase subunit SecG  30.7 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000528486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2837  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000321144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1125  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000669441  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0958  preprotein translocase subunit SecG  40.85 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.117439  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3242  preprotein translocase subunit SecG  34.83 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000345429  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0172  preprotein translocase subunit SecG  30 
 
 
110 aa  42  0.003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01686  protein-export membrane protein secG(General Secretory Pathway)  27.87 
 
 
148 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.010921  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3349  preprotein translocase, SecG subunit  29.57 
 
 
135 aa  41.2  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3611  preprotein translocase subunit SecG  32.5 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42850  preprotein translocase subunit SecG  31.45 
 
 
129 aa  40.4  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3063  preprotein translocase subunit SecG  40.58 
 
 
111 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000201334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>