169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_05555 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  99.56 
 
 
969 bp  1780    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  100 
 
 
969 bp  1812    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  100 
 
 
969 bp  1812    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03357  ISXoo7 transposase  85.29 
 
 
981 bp  737    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.880653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02541    99.88 
 
 
894 bp  1655    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03464  ISXoo7 transposase  86.06 
 
 
981 bp  793    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05555    100 
 
 
927 bp  1838    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  100 
 
 
969 bp  1812    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  99.89 
 
 
969 bp  1804    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  99.67 
 
 
969 bp  1788    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  99.78 
 
 
969 bp  1796    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04848  ISXoo6 transposase  81.85 
 
 
1020 bp  165  3e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.218685  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  80.86 
 
 
810 bp  141  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  80.86 
 
 
984 bp  141  4e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  80.53 
 
 
963 bp  133  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1381    82.41 
 
 
1326 bp  127  6e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  88.7 
 
 
216 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  88.7 
 
 
963 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  88.7 
 
 
1218 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  80.2 
 
 
924 bp  125  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  87.83 
 
 
924 bp  117  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  87.83 
 
 
981 bp  117  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  79.87 
 
 
996 bp  117  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  87.83 
 
 
990 bp  117  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  92.21 
 
 
966 bp  105  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  90.59 
 
 
960 bp  105  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  86.32 
 
 
984 bp  105  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  88.76 
 
 
981 bp  97.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  88.76 
 
 
981 bp  97.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  88.76 
 
 
981 bp  97.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  88.76 
 
 
981 bp  97.6  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  90.91 
 
 
984 bp  97.6  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    91.55 
 
 
602 bp  93.7  9e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0575    90.41 
 
 
987 bp  89.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0218438  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  90.41 
 
 
987 bp  89.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  83.21 
 
 
963 bp  89.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0887  ISMca7, transposase  90.28 
 
 
951 bp  87.7  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  84.17 
 
 
966 bp  87.7  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  88.75 
 
 
993 bp  87.7  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4648  transposase, IS4 family protein  92.19 
 
 
705 bp  87.7  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.818744  normal  0.900302 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  88.46 
 
 
963 bp  83.8  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    82.95 
 
 
979 bp  81.8  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  86.52 
 
 
960 bp  81.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  85.87 
 
 
981 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  83.19 
 
 
960 bp  77.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  83.19 
 
 
960 bp  77.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0428    85.26 
 
 
459 bp  77.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0854  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1053  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.420746  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2444  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1014 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2538  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1014 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.419682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2596  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2600  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.90039  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2965  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0493876  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2988  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2990  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2992  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3327  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.50372  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3819  TIS1021-transposase protein  91.38 
 
 
1050 bp  75.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.59092 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  92.45 
 
 
984 bp  73.8  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2057    91.07 
 
 
407 bp  71.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0408073  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0206  TIS1021 transposase  86.84 
 
 
987 bp  71.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1179  TIS1021 transposase  86.84 
 
 
987 bp  71.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02983  transposase  84.78 
 
 
375 bp  71.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  91.07 
 
 
993 bp  71.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4863  transposase IS4 family protein  91.07 
 
 
993 bp  71.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0853188  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  89.83 
 
 
144 bp  69.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  88.06 
 
 
981 bp  69.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  87.69 
 
 
966 bp  65.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  87.69 
 
 
966 bp  65.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  82.3 
 
 
984 bp  65.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  87.69 
 
 
966 bp  65.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 
981 bp  63.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1626    86.76 
 
 
1994 bp  63.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.449305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 
981 bp  63.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  86.76 
 
 
981 bp  63.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2618    86.76 
 
 
3623 bp  63.9  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.941681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>