29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04328 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04328  HmsH  100 
 
 		 680 aa  1387    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000786393  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2716  HmsH protein  66.57 
 
 		 675 aa  903    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.122053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2792  hypothetical protein  29.29 
 
 		 802 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000214855  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4285  outer membrane protein PgaA  28.64 
 
 		 820 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2141  outer membrane protein  26.07 
 
 		 822 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.115838 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1144  outer membrane protein PgaA  26.07 
 
 		 807 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2131  outer membrane protein  26.07 
 
 		 822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01026  predicted outer membrane protein  26.82 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2572  outer membrane protein PgaA  26.82 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.014315 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1266  outer membrane protein PgaA  26.82 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.632553 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01033  hypothetical protein  26.82 
 
 		 807 aa  174  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2241  outer membrane protein  25.86 
 
 		 824 aa  171  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0137  biofilm PGA synthesis protein PgaA precursor  26.26 
 
 		 798 aa  170  6e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.764186  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0177  outer membrane protein PgaA  28.07 
 
 		 826 aa  161  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.541075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4606  outer membrane protein PgaA  25.69 
 
 		 820 aa  158  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3766  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  23.87 
 
 		 821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4843  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  23.87 
 
 		 821 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0286  putative hemin-binding outer membrane transmembrane protein  23.87 
 
 		 816 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0121559  normal  0.150632 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4262  hypothetical protein  23.53 
 
 		 855 aa  123  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667534  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4104  hypothetical protein  24.04 
 
 		 876 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.81202 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3419  hypothetical protein  23.74 
 
 		 876 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.437812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3515  hypothetical protein  23.49 
 
 		 954 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.338275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1940  hypothetical protein  23.23 
 
 		 895 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3998  hypothetical protein  23.38 
 
 		 1018 aa  111  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.706875  normal  0.141155 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4482  hypothetical protein  23.34 
 
 		 797 aa  109  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1499  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 620 aa  47  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 2240 aa  47.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 		 597 aa  45.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0312  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 293 aa  44.7  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.542961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>