234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01151 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01151  bacterioferritin  100 
 
 
165 aa  334  2.9999999999999997e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1283  bacterioferritin  79.87 
 
 
162 aa  258  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.815462  normal  0.472736 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1507  bacterioferritin  71.97 
 
 
159 aa  232  2.0000000000000002e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09160  bacterioferritin  72.08 
 
 
154 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.536726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0865  bacterioferritin  72.08 
 
 
154 aa  222  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2757  bacterioferritin  69.48 
 
 
158 aa  221  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738013  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0990  bacterioferritin  71.14 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3880  bacterioferritin  70.13 
 
 
154 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1074  bacterioferritin  71.14 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.434507  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4721  bacterioferritin  68.18 
 
 
154 aa  213  8e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0653  bacterioferritin  68.18 
 
 
154 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0482  bacterioferritin  68.18 
 
 
154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0511  bacterioferritin  67.53 
 
 
154 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150479  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0515  bacterioferritin  68.18 
 
 
154 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0679585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10050  bacterioferritin protein  67.53 
 
 
154 aa  210  7e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0618256  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4521  bacterioferritin  66.88 
 
 
154 aa  210  9e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.642969  normal  0.489383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5052  bacterioferritin  68.42 
 
 
155 aa  209  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0630119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1167  bacterioferritin, subunit 1  54.9 
 
 
161 aa  164  5e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.370359  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1384  bacterioferritin  55.19 
 
 
162 aa  162  1.0000000000000001e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.132522  normal  0.711708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02052  bacterioferritin subunit 1  57.42 
 
 
155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000533514  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1077  ferritin:bacterioferritin  54.55 
 
 
162 aa  161  3e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000139302  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2529  bacterioferritin subunit 1  56.13 
 
 
156 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2114  bacterioferritin  55.19 
 
 
159 aa  160  7e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2835  bacterioferritin  52.26 
 
 
157 aa  159  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0233264 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0991  bacterioferritin  53.55 
 
 
155 aa  155  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000307533  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0958  bacterioferritin  54.19 
 
 
155 aa  155  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.874895  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3094  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  152  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3607  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.300979  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3357  bacterioferritin  52.9 
 
 
155 aa  150  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313026  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0636  bacterioferritin  52.26 
 
 
161 aa  150  8e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.554542  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3554  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0933  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0949  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.443443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3429  bacterioferritin  52.26 
 
 
155 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0282624  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2075  bacterioferritin  54.19 
 
 
155 aa  148  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.631663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0947  bacterioferritin  52.9 
 
 
155 aa  148  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2872  bacterioferritin  54.19 
 
 
155 aa  148  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0945  bacterioferritin  52.9 
 
 
155 aa  148  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0983  bacterioferritin  52.9 
 
 
155 aa  147  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.383753  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1369  bacterioferritin  52.87 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1112  bacterioferritin subunit 1  52.26 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1062  bacterioferritin  48.45 
 
 
161 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2231  bacterioferritin  49.03 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.704713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3474  bacterioferritin  49.38 
 
 
161 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3349  bacterioferritin  47.44 
 
 
156 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.381889  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2432  bacterioferritin  45.57 
 
 
157 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00217295  normal  0.283401 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4523  bacterioferritin  45.81 
 
 
158 aa  121  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477419  normal  0.0580159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14050  bacterioferritin  46.5 
 
 
156 aa  121  6e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1082  bacterioferritin  44.52 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2195  bacterioferritin  43.75 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1123  bacterioferritin  44.52 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0443  bacterioferritin  44.16 
 
 
158 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.0000427198  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4330  bacterioferritin  44.52 
 
 
157 aa  117  9e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439778  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1616  bacterioferritin  45.1 
 
 
158 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18670  bacterioferritin  45.1 
 
 
158 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.290552 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2475  bacterioferritin  43.23 
 
 
160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0762  bacterioferritin  41.94 
 
 
154 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3617  bacterioferritin  43.23 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000470757  hitchhiker  0.00317638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0281  bacterioferritin  41.4 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000088272  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0582  bacterioferritin  41.4 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000092678  normal  0.252272 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4645  bacterioferritin  43.23 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818391  normal  0.0227171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3711  bacterioferritin  43.23 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000178059  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3805  bacterioferritin  43.23 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3517  bacterioferritin  41.88 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.461973  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3754  bacterioferritin  43.23 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000103418  hitchhiker  0.00341964 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3917  bacterioferritin  41.4 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.15009e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00052  bacterioferritin  43.4 
 
 
172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002302  bacterioferritin  45.33 
 
 
158 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2144  bacterioferritin  43.23 
 
 
160 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0155041 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1111  bacterioferritin  43.23 
 
 
157 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4423  bacterioferritin  41.29 
 
 
156 aa  110  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00141601  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0403  bacterioferritin  41.94 
 
 
157 aa  110  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000898304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2763  bacterioferritin  42.58 
 
 
160 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.230388 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2776  bacterioferritin  44 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000706514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0457  bacterioferritin  40.67 
 
 
158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6242  bacterioferritin (iron storage homoprotein)  43.23 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2903  bacterioferritin  41.72 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.697742  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0048  bacterioferritin  41.77 
 
 
159 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.985932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0704  bacterioferritin  43.79 
 
 
159 aa  108  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.451244  normal  0.105237 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3810  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0101659  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3639  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103122  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3639  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000409317  normal  0.31124 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3712  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00504468  normal  0.710575 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3747  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.051812  normal  0.0497296 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03187  bacterioferritin, iron storage and detoxification protein  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0377  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0377  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.705222 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03138  hypothetical protein  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3530  bacterioferritin  41.29 
 
 
158 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.457026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0299  bacterioferritin  42.41 
 
 
159 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.91961  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0752  bacterioferritin  42.58 
 
 
159 aa  107  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3764  bacterioferritin  41.33 
 
 
161 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4120  bacterioferritin  43.87 
 
 
160 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.373564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3445  bacterioferritin  42.58 
 
 
160 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0660653  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1411  bacterioferritin  41.83 
 
 
154 aa  106  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380056  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0248  bacterioferritin  42.41 
 
 
159 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0219  bacterioferritin  40.52 
 
 
159 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3227  hypothetical protein  41.33 
 
 
165 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0213  bacterioferritin  40.76 
 
 
159 aa  105  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4546  bacterioferritin  38.71 
 
 
154 aa  106  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556598  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>