94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5627 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5627    100 
 
 		 495 bp  981    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3793  transposase family protein  89.29 
 
 		 981 bp  561  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  86.88 
 
 		 981 bp  438  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    83.82 
 
 		 979 bp  121  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2887  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00537517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4971  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3194  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0837027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3208  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 1017 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0135274  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3731  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0359746  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3963  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.038297  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4152  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4253  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4347  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4596  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.234602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4643  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4702  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5428  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.826395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5440  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5556  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.656873  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5564  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5582  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0017    91.89 
 
 		 937 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0712662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2541  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182594  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0171  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0534  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0780  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0844  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0902  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.312998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0903  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1166  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1188  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.584401  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1229  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.520476  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1310  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.851116  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1315  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2836  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.967109  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2432  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000860937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2426  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0162473  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2328  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00380976  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2324  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000979415  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2010  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2234  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.210132  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2008  ISPssy, transposase  91.89 
 
 		 978 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1407  ISPssy transposase or derivative  91.89 
 
 		 840 bp  99.6  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.286806  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0096  transposase IS4  93.85 
 
 		 984 bp  97.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  79.27 
 
 		 981 bp  93.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  79.27 
 
 		 981 bp  93.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  79.27 
 
 		 981 bp  93.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  79.27 
 
 		 981 bp  93.7  4e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1356  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 984 bp  83.8  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  83.2 
 
 		 981 bp  81.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0428    77.81 
 
 		 459 bp  79.8  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4648  transposase, IS4 family protein  89.06 
 
 		 705 bp  71.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.818744  normal  0.900302 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0382  ISRSO18-transposase protein  81.68 
 
 		 960 bp  69.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0605  ISRSO18-transposase protein  81.68 
 
 		 960 bp  69.9  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32190  Transposase, IS4 protein  80.79 
 
 		 981 bp  69.9  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04736  ISXoo6 transposase  81.75 
 
 		 924 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04439  ISXoo6 transposase  81.75 
 
 		 963 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03937  ISXoo6 transposase  81.75 
 
 		 1218 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03428  ISXoo6 transposase  81.75 
 
 		 963 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01973  hypothetical protein  81.75 
 
 		 216 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0141734  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00477  ISXoo6 transposase  81.75 
 
 		 984 bp  67.9  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24610  Transposase, IS4  95.12 
 
 		 144 bp  65.9  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1522    80.77 
 
 		 225 bp  60  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02301  ISXoo6 transposase  80.95 
 
 		 981 bp  60  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.958218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01370  ISXoo6 transposase  80.95 
 
 		 990 bp  60  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1381    86.89 
 
 		 1326 bp  58  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04727  ISXoo6 transposase  80.8 
 
 		 810 bp  58  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.714363  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1779    96.88 
 
 		 275 bp  56  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.025071 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0575    80.15 
 
 		 987 bp  54  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0218438  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01501  ISXoo6 transposase  80.16 
 
 		 996 bp  52  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.543852  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5648  transposase IS4 family protein  86.79 
 
 		 963 bp  50.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.290904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0590  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.605879  normal  0.456772 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1459  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2004  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.094383  normal  0.686139 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 960 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2954  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 963 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0168264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3096  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0728273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3367  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.105389  normal  0.324658 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3426  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3766  transposase, IS4 family protein  90.24 
 
 		 981 bp  50.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2598  ISRSO18-transposase protein  93.94 
 
 		 960 bp  50.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3099  transposase, IS4  96.55 
 
 		 336 bp  50.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.131295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0618  ISRSO18-transposase protein  93.75 
 
 		 963 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1753  transposase, IS4 family protein  87.5 
 
 		 984 bp  48.1  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.808639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1308  ISRSO18-transposase protein  80.36 
 
 		 963 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00519  ISXoo6 transposase  81.25 
 
 		 924 bp  48.1  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  87.5 
 
 		 993 bp  48.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 966 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 966 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  93.75 
 
 		 966 bp  48.1  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03464  ISXoo7 transposase  89.74 
 
 		 981 bp  46.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  79.39 
 
 		 987 bp  46.1  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03357  ISXoo7 transposase  89.74 
 
 		 981 bp  46.1  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.880653  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0023  DNA-directed RNA polymerase subunit beta'  100 
 
 		 4284 bp  46.1  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>