23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5043 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5043  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  377  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.307475  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0480  TM2  94.03 
 
 		 134 aa  261  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.748725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4145  TM2 domain-containing protein  84.62 
 
 		 132 aa  234  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0374  TM2 domain-containing protein  76.81 
 
 		 139 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5316  TM2  73.91 
 
 		 144 aa  223  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4964  TM2 domain-containing protein  74.82 
 
 		 139 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5141  TM2 domain-containing protein  74.1 
 
 		 139 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.143411  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5091  hypothetical protein  74.82 
 
 		 139 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.710135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05210  hypothetical protein  75.19 
 
 		 134 aa  208  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0498  hypothetical protein  74.42 
 
 		 134 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0167  TM2 domain-containing protein  74.6 
 
 		 135 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03100  TM2 domain-containing hypothetical protein  79.84 
 
 		 133 aa  202  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.564885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1993  TM2 domain-containing protein  72 
 
 		 135 aa  200  9e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0383529  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0299  TM2 domain containing protein  70.31 
 
 		 135 aa  197  9e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000251621  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2502  TM2  77.52 
 
 		 140 aa  194  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000265771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1622  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  187  8e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4937  TM2 domain containing protein  46.15 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2399  TM2 domain-containing protein  46.58 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324538  normal  0.432831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1825  TM2 domain containing protein  46.97 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0479  TM2 domain-containing protein  42.35 
 
 		 114 aa  58.2  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4957  TM2  50 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2397  TM2 domain containing protein  54.29 
 
 		 113 aa  45.4  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.25927e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1089  TM2  33.33 
 
 		 117 aa  42  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>