101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3614 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3223  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  1885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199078  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3528  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  1885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.418337  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3614    100 
 
 		 951 bp  1885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217633  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4725  IS52, transposase  100 
 
 		 978 bp  1885    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3653    100 
 
 		 210 bp  369  1e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0544552  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0210  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0489  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0714  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1467  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0317213  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1565  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.004757  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1626    91.18 
 
 		 1994 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.449305  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1627  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0994008  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1662  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.627269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1816  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000243459  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2276  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.540999  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2310  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0945239  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2314  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0761785  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2618    91.18 
 
 		 3623 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.941681  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2619  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2970  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.646128  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3076  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3325  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3346  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3107  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3892  transposase IS4 family protein  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0642  IS5 transposase  91.18 
 
 		 993 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0956986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2257  IS5 transposase  91.18 
 
 		 993 bp  87.7  0.000000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0023  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.938635  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0652  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.834508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0934  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1124  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1856  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.859503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2076  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3314  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4088  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0322419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4707  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4726  IS5 transposase  91.18 
 
 		 981 bp  87.7  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.301836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3354  transposase IS4 family protein  86.9 
 
 		 981 bp  79.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2295  transposase IS4 family protein  85.26 
 
 		 984 bp  77.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0556761  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0076  transposase IS4 family protein  84.82 
 
 		 966 bp  75.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0258707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1110  transposase IS4 family protein  84.82 
 
 		 966 bp  75.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1561  transposase IS4 family protein  84.82 
 
 		 966 bp  75.8  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal  0.983286 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0436  transposase IS4 family protein  85.88 
 
 		 981 bp  73.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0489496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0909  transposase IS4 family protein  85.88 
 
 		 981 bp  73.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2101  transposase IS4 family protein  85.88 
 
 		 981 bp  73.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3025  transposase IS4 family protein  85.88 
 
 		 981 bp  73.8  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.965699  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1136  ISRSO18-transposase protein  82.03 
 
 		 966 bp  71.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.835296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3838  transposase, IS4 family protein  89.83 
 
 		 981 bp  69.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000231978 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0915    89.83 
 
 		 979 bp  69.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0604  transposase, IS4 family protein  84.09 
 
 		 945 bp  63.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3712  transposase, IS4 family protein  84.09 
 
 		 945 bp  63.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.216949  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3832  transposase, IS4 family protein  84.09 
 
 		 945 bp  63.9  0.00000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0569  IS5 transposase  85.92 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0800  IS5 transposase  85.92 
 
 		 981 bp  61.9  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5898    83.52 
 
 		 602 bp  61.9  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.215704  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4027  transposase, IS4 family protein  84.15 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0970154  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0575    85.71 
 
 		 987 bp  60  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0218438  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3395  transposase, IS4 family protein  85.71 
 
 		 987 bp  60  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.919849 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00267  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00278  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00284  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.454777  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00368  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.161909  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00491  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01080  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000904995  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01500  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.549499  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01751  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01858  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01862  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.854322  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02304  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02541    87.1 
 
 		 894 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02738  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.273323  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03194  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03357  ISXoo7 transposase  87.93 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.880653  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03464  ISXoo7 transposase  87.93 
 
 		 981 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04034  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04167  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04603  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04676  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04707  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04722  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.24864  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04748  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.588159  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04767  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04850  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0577284  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05516  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05526  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05555    87.1 
 
 		 927 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05577  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.461805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05625  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0316217  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05639  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05689  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06088  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06239  ISXo1 transposase  87.1 
 
 		 969 bp  60  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1704  ISRSO18-transposase protein  86.15 
 
 		 966 bp  58  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0125656  normal  0.151951 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2016  transposase, IS4 family protein  87.5 
 
 		 993 bp  56  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2718  transposase, IS4 family protein  85.94 
 
 		 993 bp  56  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.00012414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4823  transposase IS4 family protein  83.75 
 
 		 981 bp  56  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1381    83.13 
 
 		 1326 bp  54  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0947  IS5 transposase  86.44 
 
 		 981 bp  54  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3935    86.21 
 
 		 947 bp  52  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967074  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2927  transposase, IS4 family protein  86.79 
 
 		 960 bp  50.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>