21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2024 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2024  hypothetical protein  100 
 
 		 279 aa  578  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1833  hypothetical protein  81.72 
 
 		 279 aa  494  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.432848 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3943  periplasmic binding protein  64.98 
 
 		 277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3565  extracellular solute-binding protein  60.32 
 
 		 252 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4246  periplasmic binding protein  59.29 
 
 		 266 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1622  extracellular solute-binding protein  58.89 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.12881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3812  extracellular solute-binding protein  63.09 
 
 		 266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2686  extracellular solute-binding protein  54.98 
 
 		 263 aa  300  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0129689  normal  0.492762 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2687  hypothetical protein  48.75 
 
 		 261 aa  244  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0951528  normal  0.504159 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1473  hypothetical protein  37.5 
 
 		 268 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2113  hypothetical protein  36.59 
 
 		 265 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.018771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1618  hypothetical protein  36.32 
 
 		 268 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1839  hypothetical protein  33.84 
 
 		 275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1878  amino acid ABC transporter periplasmic protein  37.95 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.201916  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1854  hypothetical protein  33.85 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.549839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2471  hypothetical protein  33.85 
 
 		 281 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.519475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1807  hypothetical protein  35.37 
 
 		 276 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1815  hypothetical protein  36.61 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3870  hypothetical protein  26.07 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4554  hypothetical protein  38.67 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19140  cyclohexadienyl dehydratase precursor  35.14 
 
 		 268 aa  42.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.288191  normal  0.371616 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>