35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1259 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1259  hypothetical protein  100 
 
 
311 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.878186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14170  hypothetical protein  96.46 
 
 
311 aa  604  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.055058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0981  hypothetical protein  81.03 
 
 
311 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3552  glutathione S-transferase-like protein  76.53 
 
 
311 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.872782  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1263  hypothetical protein  71.38 
 
 
310 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0732347  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1081  hypothetical protein  69.45 
 
 
310 aa  454  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.336089  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11360  hypothetical protein  63.99 
 
 
311 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1438  Glutathione S-transferase domain  47.91 
 
 
318 aa  301  1e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44949  normal  0.0129155 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1479  Glutathione S-transferase domain protein  45.66 
 
 
318 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.627969  normal  0.0228599 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1783  putative glutathione S-transferase-related protein  50.16 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.402117 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1768  putative glutathione S-transferase-related protein  46.95 
 
 
318 aa  276  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.628601  normal  0.290631 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2490  putative glutathione S-transferase-related protein  46.65 
 
 
313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1848  putative glutathione S-transferase-related protein  45.78 
 
 
315 aa  268  7e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.417859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2869  putative glutathione S-transferase-related protein  45.45 
 
 
318 aa  266  4e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.658841  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2563  putative glutathione S-transferase-related protein  45.51 
 
 
312 aa  265  8.999999999999999e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.569618  normal  0.331421 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2004  putative glutathione S-transferase-related protein  46.43 
 
 
308 aa  263  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344243  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1699  putative glutathione S-transferase-related protein  46.1 
 
 
308 aa  261  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.7383 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1847  putative glutathione S-transferase-related protein  42.31 
 
 
310 aa  253  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.116781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2915  putative glutathione S-transferase-related protein  44.05 
 
 
312 aa  247  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1650  hypothetical protein  38.22 
 
 
310 aa  207  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227985  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03487  conserved hypothetical protein  28.49 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.67628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1478  putative glutathione S-transferase  31.31 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.184026  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01821  putative glutathione S-transferase  31.31 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0879846  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2348  putative glutathione S-transferase  30.7 
 
 
246 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0788  glutathione S-transferase  30.7 
 
 
264 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.200068 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0343  putative glutathione S-transferase  29.44 
 
 
241 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.889809  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26121  putative glutathione S-transferase  28.08 
 
 
241 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1478  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.94 
 
 
263 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.204587  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01251  putative glutathione S-transferase  26.77 
 
 
241 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.621374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1907  glutathione S-transferase-like protein  27.72 
 
 
263 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464392  normal  0.0635336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0854  Glutathione S-transferase domain protein  26.24 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0881  glutathione S-transferase domain protein  26.24 
 
 
263 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0898679  normal  0.46136 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01231  putative glutathione S-transferase  21.63 
 
 
241 aa  45.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.168526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6850  Glutathione S-transferase domain protein  26.15 
 
 
213 aa  43.1  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.226481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2019  glutathione S-transferase domain-containing protein  37.5 
 
 
262 aa  42.7  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.569659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>