30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0097 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0097  site-specific recombinase, phage integrase family protein  100 
 
 		 617 aa  1280    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6274  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.76 
 
 		 650 aa  413  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.67172  normal  0.482293 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5714  site-specific recombinase, phage integrase family protein  38.47 
 
 		 650 aa  393  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6753  site-specific recombinase, phage integrase family protein  37.56 
 
 		 650 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4322  hypothetical protein  28.52 
 
 		 606 aa  211  3e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6254  phage integrase  26.58 
 
 		 616 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3615  site-specific recombinase, phage integrase family  26.82 
 
 		 533 aa  188  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455772  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7360  phage integrase  25.15 
 
 		 688 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3442  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3481  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 600 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.487769  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1214  phage integrase family protein  33.78 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4224  hypothetical protein  24.78 
 
 		 707 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4400  hypothetical protein  23.76 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4262  hypothetical protein  23.76 
 
 		 683 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3585  hypothetical protein  29.07 
 
 		 289 aa  62.4  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3463  integrase family protein  23.41 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1897  integrase family protein  23.41 
 
 		 680 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.17871  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1212  phage integrase family protein  22.25 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.660438  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0191  phage integrase family protein  32.62 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0245389  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7366  integrase family protein  22.54 
 
 		 645 aa  56.6  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1471  putative phage integrase  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7708  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0733345  normal  0.10035 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7406  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7313  phage integrase family protein  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3330  hypothetical protein  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0268  hypothetical protein  23.45 
 
 		 624 aa  48.9  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3931  phage integrase family protein  26.59 
 
 		 741 aa  47  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.117648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4742  site-specific recombinase, phage integrase family  36.78 
 
 		 682 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.199879  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0071  site-specific recombinase, phage integrase family protein  21.26 
 
 		 700 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.420538  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4252  phage integrase family protein  23.84 
 
 		 694 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987809 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>