18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5395 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  100 
 
 		 281 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  47.97 
 
 		 282 aa  271  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  50 
 
 		 279 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  45.96 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  28.03 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  30.53 
 
 		 358 aa  57  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  23.28 
 
 		 393 aa  55.5  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  25.35 
 
 		 355 aa  54.3  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  24.2 
 
 		 396 aa  50.1  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  21.66 
 
 		 390 aa  50.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  20.18 
 
 		 323 aa  49.7  0.00005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  20.87 
 
 		 383 aa  49.3  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  21.66 
 
 		 390 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  24.84 
 
 		 384 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  22.29 
 
 		 390 aa  47  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  21.15 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  25.69 
 
 		 358 aa  45.4  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  25.83 
 
 		 386 aa  42.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>