15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_91537 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_91537  chitinase  100 
 
 
313 aa  633    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68871  chitinase 3 precursor  60 
 
 
437 aa  345  6e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.688997  normal  0.0498735 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48142  chitinase 2 precursor  56 
 
 
397 aa  331  1e-89  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.333864  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_11059  class III chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G03530)  33.6 
 
 
562 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.979608 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08241  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92223]  36.25 
 
 
961 aa  177  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.879175  normal  0.0215178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2016  hypothetical protein  25.33 
 
 
313 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.630199  normal  0.0408186 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  22.34 
 
 
1362 aa  45.8  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  23.13 
 
 
420 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  25.89 
 
 
846 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  22.56 
 
 
846 aa  45.4  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  27.17 
 
 
848 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 
551 aa  44.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  26.21 
 
 
543 aa  43.9  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  30.7 
 
 
846 aa  43.5  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.15 
 
 
803 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>