16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_84899 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_84899  predicted protein  100 
 
 		 697 aa  1425    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05950  AP-2 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10340)  42.77 
 
 		 717 aa  574  1.0000000000000001e-162  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04170  vesicle-mediated transport-related protein, putative  41.31 
 
 		 696 aa  474  1e-132  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.567808  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH03830  clathrin binding protein, putative  35.93 
 
 		 755 aa  379  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL03830  clathrin binding protein, putative  36.88 
 
 		 732 aa  374  1e-102  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03029  AP-1 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08970)  33.17 
 
 		 766 aa  326  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0965274 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119607  Beta adaptin-like protein  33.83 
 
 		 551 aa  311  2e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74268  beta-adaptin, large subunit of the clathrin-associated protein (AP-1) complex  33.96 
 
 		 736 aa  279  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_54730  predicted protein  24.44 
 
 		 805 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.442884  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_86921  predicted protein  25.89 
 
 		 785 aa  182  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00165  AP-3 adaptor complex subunit beta, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G11360)  26.04 
 
 		 841 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.318304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44118  predicted protein  22.22 
 
 		 676 aa  136  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.139737  normal  0.0310937 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_54789  predicted protein  24.68 
 
 		 1205 aa  90.9  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88879  clathrin assembly complex beta adaptin component  24.13 
 
 		 817 aa  87.4  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.789212 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06410  Golgi to vacuole transport-related protein, putative  20.95 
 
 		 835 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0826  heat domain-containing protein  22.36 
 
 		 1328 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.851003  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>